To our users Please note that the HCV database site is no longer funded. We try to keep the database updated and the tools running, but unfortunately, we cannot guarantee we can provide help for using this site. Data won't be manually curated either.
#k codon indel-tally syn-tally nonsyn-tally #k The number of codons is: 191 #k The average behavior for 9045 comparisons: #k Cumulative Per Codon #k __________________ __________________ #k codon indel syn nonsyn indel syn nonsyn aa avg syn 10 avg nonsyn 10 entropy Hb 1 0 0 0 0 0 0 M 0.055 0.02 0 0 2 0 0 0 0 0 0 S 0.055 0.023 0 0 3 0 0.37 0 0 0.37 0 T 0.055 0.029 0 0 4 0 0.37 0.06 0 0 0.06 N 0.024 0.032 0.15 -0.15 5 0 0.42 0.09 0 0.04 0.03 P 0.025 0.026 0.044 -0.044 6 0 0.42 0.09 0 0 0 K 0.022 0.023 0 0 7 0 0.56 0.09 0 0.14 0 P 0.023 0.032 0 0 8 0 0.56 0.09 0 0 0 Q 0.049 0.032 0 0 9 0 0.56 0.1 0 0 0.01 R 0.052 0.032 0.044 -0.044 10 0 0.56 0.2 0 0 0.1 K 0.052 0.031 0.225 -0.225 11 0 0.56 0.23 0 0 0.03 T 0.053 0.021 0.087 -0.087 12 0 0.56 0.29 0 0 0.06 K 0.056 0.021 0.121 -0.121 13 0 0.61 0.32 0 0.06 0.03 R 0.089 0.018 0 0 14 0 0.63 0.32 0 0.01 0 N 0.084 0.015 0 0 15 0 0.64 0.32 0 0.01 0 T 0.086 0.015 0 0 16 0 0.66 0.41 0 0.01 0.09 N 0.085 0.015 0.213 -0.213 17 0 1.06 0.41 0 0.4 0 R 0.123 0.006 0 0 18 0 1.09 0.41 0 0.03 0 R 0.122 0.007 0 0 19 0 1.09 0.41 0 0 0 P 0.135 0.007 0 0 20 0 1.1 0.41 0 0.01 0 Q 0.135 0.008 0 0 21 0 1.13 0.44 0 0.03 0.03 N 0.134 0.009 0.087 -0.087 22 0 1.46 0.47 0 0.33 0.03 V 0.142 0.006 0.087 -0.087 23 0 1.47 0.47 0 0.01 0 K 0.116 0.003 0 0 24 0 1.5 0.47 0 0.03 0 F 0.116 0.003 0 0 25 0 1.5 0.47 0 0 0 P 0.117 0.003 0 0 26 0 1.89 0.47 0 0.39 0 G 0.12 0.004 0 0 27 0 2.28 0.48 0 0.39 0.01 G 0.124 0.005 0.044 -0.044 28 0 2.44 0.48 0 0.16 0 G 0.086 0.005 0 0 29 0 2.44 0.5 0 0 0.01 Q 0.073 0.006 0.044 -0.044 30 0 2.44 0.51 0 0 0.01 I 0.076 0.005 0.044 -0.044 31 0 2.55 0.51 0 0.11 0 V 0.076 0.004 0 0 32 0 2.63 0.51 0 0.07 0 G 0.068 0.004 0 0 33 0 2.64 0.51 0 0.01 0 G 0.098 0.004 0 0 34 0 2.69 0.51 0 0.04 0 V 0.132 0.011 0 0 35 0 2.71 0.53 0 0.03 0.01 C 0.128 0.015 0.044 -0.044 36 0 3.15 0.54 0 0.43 0.01 L 0.126 0.014 0.044 -0.044 37 0 3.16 0.56 0 0.01 0.01 L 0.084 0.013 0 0 38 0 3.19 0.57 0 0.03 0.01 P 0.087 0.012 0.044 -0.044 39 0 3.22 0.57 0 0.03 0 R 0.087 0.014 0 0 40 0 3.22 0.57 0 0 0 R 0.13 0.028 0 0 41 0 3.25 0.57 0 0.03 0 G 0.134 0.028 0 0 42 0 3.62 0.57 0 0.37 0 P 0.131 0.029 0 0 43 0 3.97 0.64 0 0.35 0.07 R 0.095 0.033 0.175 -0.175 44 0 3.97 0.69 0 0 0.04 V 0.064 0.028 0.107 -0.107 45 0 3.98 0.69 0 0.01 0 G 0.068 0.024 0 0 46 0 4 0.69 0 0.01 0 V 0.07 0.024 0 0 47 0 4.04 0.69 0 0.04 0 R 0.086 0.025 0 0 48 0 4.07 0.72 0 0.03 0.03 A 0.086 0.025 0.121 -0.121 49 0 4.53 0.86 0 0.46 0.14 T 0.092 0.023 0.299 -0.299 50 0 4.57 0.86 0 0.04 0 R 0.084 0.009 0 0 51 0 4.57 0.87 0 0 0.01 K 0.115 0.009 0.044 -0.044 52 0 4.59 0.92 0 0.01 0.04 T 0.15 0.011 0.121 -0.121 53 0 4.63 0.94 0 0.04 0.02 S 0.185 0.008 0.044 -0.044 54 0 4.67 0.94 0 0.04 0 E 0.224 0.006 0 0 55 0 4.7 0.94 0 0.03 0 R 0.223 0.007 0 0 56 0 4.86 0.95 0 0.17 0.01 S 0.227 0.007 0.044 -0.044 57 0 4.91 0.95 0 0.04 0 Q 0.216 0.006 0 0 58 0 4.99 0.97 0 0.09 0.01 P 0.215 0.007 0.044 -0.044 59 0 5.38 0.97 0 0.38 0 R 0.239 0.016 0 0 60 0 5.73 0.97 0 0.35 0 G 0.234 0.017 0 0 61 0 6.07 1 0 0.35 0.03 R 0.232 0.062 0.087 -0.087 62 0 6.43 1.02 0 0.36 0.01 R 0.198 0.062 0.044 -0.044 63 0 6.86 1.02 0 0.43 0 Q 0.163 0.069 0 0 64 0 6.89 1.03 0 0.03 0.01 P 0.144 0.069 0.044 -0.044 65 0 6.96 1.03 0 0.07 0 I 0.145 0.071 0 0 66 0 7.02 1.03 0 0.06 0 P 0.138 0.134 0 0 67 0 7.05 1.04 0 0.03 0.01 K 0.132 0.135 0.044 -0.044 68 0 7.38 1.15 0 0.33 0.1 A 0.146 0.137 0.225 -0.225 69 0 7.71 1.16 0 0.33 0.01 R 0.118 0.129 0.044 -0.044 70 0.01 8.03 1.61 0.01 0.33 0.45 R 0.103 0.128 0.714 -0.714 71 0.01 8.05 1.64 0 0.01 0.03 P 0.076 0.085 0.077 -0.077 72 0.01 8.05 1.72 0 0.01 0.08 E 0.1 0.085 0.121 -0.121 73 0.01 8.29 1.72 0 0.24 0 G 0.116 0.077 0 0 74 0.01 8.33 1.75 0 0.04 0.03 R 0.092 0.077 0.087 -0.087 75 0.01 8.33 2.38 0 0 0.63 S 0.094 0.074 1.037 -1.037 76 0.01 8.33 2.39 0 0 0.01 W 0.1 0.011 0.044 -0.044 77 0.01 8.5 2.42 0 0.17 0.03 A 0.115 0.011 0.077 -0.077 78 0.01 8.55 2.44 0 0.05 0.02 Q 0.108 0.017 0.044 -0.044 79 0.01 8.73 2.44 0 0.18 0 P 0.14 0.016 0 0 80 0.01 8.79 2.46 0 0.06 0.02 G 0.123 0.016 0.044 -0.044 81 0.01 9.04 2.49 0 0.25 0.03 Y 0.151 0.014 0.077 -0.077 82 0.01 9.21 2.49 0 0.17 0 P 0.147 0.134 0 0 83 0.01 9.21 2.49 0 0 0 W 0.144 0.134 0 0 84 0.01 9.27 2.49 0 0.06 0 P 0.144 0.134 0 0 85 0.01 9.32 2.49 0 0.06 0 L 0.174 0.139 0 0 86 0.01 9.47 2.5 0 0.15 0.01 Y 0.174 0.14 0.044 -0.044 87 0.01 9.57 2.59 0 0.1 0.09 G 0.159 0.139 0.182 -0.182 88 0.01 9.95 2.6 0 0.37 0.01 N 0.152 0.131 0.044 -0.044 89 0.01 9.96 2.6 0 0.01 0 E 0.118 0.131 0 0 90 0.01 10.3 2.6 0 0.34 0 G 0.162 0.131 0 0 91 0.01 10.51 3.83 0 0.21 1.23 C 0.131 0.131 1.146 -1.146 92 0.01 10.65 3.83 0 0.14 0 G 0.166 0.016 0 0 93 0.01 10.65 3.83 0 0 0 W 0.158 0.017 0 0 94 0.01 11.01 3.88 0 0.36 0.05 A 0.206 0.017 0.087 -0.087 95 0.01 11.06 3.89 0 0.06 0.01 G 0.176 0.012 0.044 -0.044 96 0.01 11.06 3.89 0 0 0 W 0.173 0.012 0 0 97 0.01 11.09 3.91 0 0.03 0.01 L 0.2 0.03 0.044 -0.044 98 0.01 11.12 3.92 0 0.03 0.01 L 0.197 0.03 0.044 -0.044 99 0.01 11.57 3.92 0 0.45 0 S 0.197 0.029 0 0 100 0.01 11.6 3.92 0 0.03 0 P 0.168 0.029 0 0 101 0.01 12.17 4.01 0 0.56 0.08 R 0.219 0.069 0.175 -0.175 102 0.01 12.22 4.02 0 0.06 0.01 G 0.164 0.061 0.044 -0.044 103 0.01 12.7 4.02 0 0.48 0 S 0.159 0.061 0 0 104 0.01 12.76 4.02 0 0.06 0 R 0.115 0.062 0 0 105 0.01 12.79 4.04 0 0.03 0.01 P 0.122 0.064 0.044 -0.044 106 0.01 13.06 4.21 0 0.27 0.18 S 0.122 0.069 0.288 -0.288 107 0.01 13.06 4.23 0 0 0.01 R 0.102 0.051 0.044 -0.044 108 0.01 13.09 4.23 0 0.03 0 G 0.148 0.051 0 0 109 0.01 13.25 4.23 0 0.16 0 P 0.163 0.052 0 0 110 0.01 13.79 4.62 0 0.54 0.4 S 0.162 0.053 0.649 -0.649 111 0.01 13.81 4.62 0 0.01 0 D 0.108 0.013 0 0 112 0.01 13.82 4.64 0 0.01 0.01 P 0.114 0.013 0.044 -0.044 113 0.01 13.87 4.65 0 0.04 0.01 R 0.113 0.013 0.044 -0.044 114 0.01 14 4.67 0 0.13 0.02 R 0.109 0.012 0.044 -0.044 115 0.01 14.03 4.73 0 0.03 0.06 R 0.103 0.01 0.15 -0.15 116 0.01 14.1 4.73 0 0.07 0 S 0.101 0.005 0 0 117 0.01 14.56 4.74 0 0.46 0.01 R 0.135 0.009 0.044 -0.044 118 0.01 14.74 4.76 0 0.18 0.01 N 0.135 0.008 0.044 -0.044 119 0.01 14.88 4.77 0 0.15 0.01 L 0.124 0.007 0.044 -0.044 120 0.01 14.88 4.77 0 0 0 G 0.113 0.006 0 0 121 0.01 14.96 4.77 0 0.07 0 K 0.116 0.013 0 0 122 0.01 14.96 4.78 0 0 0.01 V 0.109 0.016 0.044 -0.044 123 0.01 14.96 4.78 0 0 0 I 0.123 0.015 0 0 124 0.01 15.03 4.78 0 0.07 0 D 0.123 0.018 0 0 125 0.01 15.04 4.8 0 0.01 0.01 T 0.116 0.021 0.044 -0.044 126 0.01 15.46 4.84 0 0.41 0.04 L 0.116 0.02 0.121 -0.121 127 0.01 15.91 4.84 0 0.46 0 T 0.079 0.016 0 0 128 0.01 15.98 4.84 0 0.07 0 C 0.071 0.02 0 0 129 0.01 16.03 4.84 0 0.04 0 G 0.067 0.02 0 0 130 0.01 16.06 4.92 0 0.03 0.07 F 0.082 0.023 0.158 -0.158 131 0.01 16.06 4.95 0 0 0.03 A 0.082 0.016 0.087 -0.087 132 0.01 16.2 4.95 0 0.14 0 D 0.092 0.013 0 0 133 0.01 16.2 4.97 0 0 0.03 L 0.089 0.027 0.087 -0.087 134 0.01 16.2 5 0 0 0.03 M 0.127 0.024 0.087 -0.087 135 0.01 16.21 5 0 0.01 0 G 0.187 0.032 0 0 136 0.01 16.25 5 0 0.04 0 Y 0.228 0.038 0 0 137 0.01 16.64 5.05 0 0.38 0.04 I 0.232 0.038 0.121 -0.121 138 0.01 16.67 5.05 0 0.03 0 P 0.204 0.063 0 0 139 0.01 16.85 5.08 0 0.19 0.03 L 0.204 0.067 0.077 -0.077 140 0.01 16.88 5.08 0 0.03 0 V 0.201 0.064 0 0 141 0.01 16.98 5.08 0 0.1 0 G 0.213 0.073 0 0 142 0.01 17.1 5.22 0 0.11 0.14 A 0.23 0.073 0.331 -0.331 143 0.01 17.48 5.22 0 0.38 0 P 0.269 0.06 0 0 144 0.01 18.08 5.33 0 0.6 0.11 L 0.245 0.06 0.15 -0.15 145 0.01 18.5 5.39 0 0.42 0.06 G 0.235 0.049 0.15 -0.15 146 0.03 18.59 5.39 0.01 0.08 0 G 0.207 0.043 0.044 -0.044 147 0.04 18.69 5.68 0.01 0.1 0.29 A 0.217 0.043 0.51 -0.51 148 0.04 18.71 5.72 0 0.03 0.04 A 0.226 0.017 0.121 -0.121 149 0.04 18.88 5.72 0 0.16 0 R 0.227 0.023 0 0 150 0.04 19.03 5.81 0 0.15 0.09 A 0.247 0.023 0.202 -0.202 151 0.04 19.3 5.81 0 0.27 0 L 0.232 0.018 0 0 152 0.04 19.8 5.83 0 0.5 0.01 - 0.209 0.029 0.087 -0.087 153 0.04 19.94 5.83 0 0.14 0 H 0.163 0.03 0 0 154 0.04 20.44 5.83 0 0.5 0 G 0.168 0.03 0 0 155 0.04 20.58 5.83 0 0.14 0 V 0.141 0.03 0 0 156 0.04 20.76 5.83 0 0.18 0 R 0.127 0.03 0 0 157 0.04 20.95 5.86 0 0.19 0.03 V 0.11 0.03 0.077 -0.077 158 0.04 20.99 5.96 0 0.04 0.1 L 0.095 0.027 0.204 -0.204 159 0.04 21.35 5.96 0 0.36 0 - 0.136 0.017 0 0 160 0.04 21.35 6 0 0 0.04 D 0.174 0.04 0.121 -0.121 161 0.04 21.4 6.11 0 0.04 0.11 G 0.213 0.037 0.225 -0.225 162 0.04 21.43 6.14 0 0.04 0.02 V 0.21 0.026 0.044 -0.044 163 0.04 21.62 6.14 0 0.19 0 - 0.206 0.024 0.044 -0.044 164 0.04 21.85 6.14 0 0.23 0 - 0.203 0.028 0.044 -0.044 165 0.04 21.85 6.14 0 0 0 - 0.21 0.028 0.044 -0.044 166 0.04 21.87 6.14 0 0.01 0 - 0.211 0.028 0.044 -0.044 167 0.04 21.91 6.14 0 0.04 0 - 0.213 0.029 0.044 -0.044 168 0.04 22.36 6.14 0 0.45 0 N 0.209 0.029 0 0 169 0.04 23.1 6.37 0 0.74 0.23 L 0.209 0.036 0.077 -0.077 170 0.04 23.49 6.38 0 0.39 0.01 - 0.196 0.02 0.044 -0.044 171 0.04 23.5 6.38 0 0.01 0 G 0.194 0.02 0 0 172 0.04 23.5 6.38 0 0 0 C 0.252 0.024 0 0 173 0.04 23.67 6.43 0 0.16 0.04 S 0.306 0.028 0.107 -0.107 174 0.04 23.97 6.43 0 0.3 0 - 0.339 0.024 0.044 -0.044 175 0.04 23.98 6.43 0 0.01 0 - 0.353 0.024 0.044 -0.044 176 0.04 24.01 6.44 0 0.03 0.01 I 0.403 0.027 0.044 -0.044 177 0.04 24.01 6.44 0 0 0 F 0.438 0.027 0 0 178 0.04 24.46 6.52 0 0.45 0.07 L 0.468 0.101 0.087 -0.087 179 0.04 25.08 6.59 0 0.61 0.07 L 0.461 0.096 0.044 -0.044 180 0.04 25.45 6.6 0 0.37 0.01 - 0.427 0.105 0.044 -0.044 181 0.04 26.04 6.65 0 0.59 0.04 L 0.427 0.104 0 0 182 0.04 26.58 6.69 0 0.54 0.04 L 0.407 0.101 0.044 -0.044 183 0.04 27.07 6.69 0 0.49 0 S 0.392222222 0.107777778 0 0 184 0.04 27.51 6.69 0 0.44 0 C 0.38 0.12125 0 0 185 0.04 28.02 6.72 0 0.51 0.03 L 0.371428571 0.138571429 0.044 -0.044 186 0.04 28.39 6.73 0 0.38 0.01 T 0.348333333 0.156666667 0.044 -0.044 187 0.06 28.7 7.47 0.01 0.3 0.74 V 0.342 0.186 0.961 -0.961 188 0.07 29.07 7.49 0.01 0.38 0.02 P 0.3525 0.0475 0.087 -0.087 189 0.09 29.34 7.65 0.01 0.27 0.16 A 0.343333333 0.056666667 0.379 -0.379 190 0.12 29.71 7.65 0.03 0.37 0 S 0.38 0.005 0.044 -0.044 191 0.15 30.1 7.66 0.03 0.39 0.01 A 0.39 0.01 0.121 -0.121