To our users Please note that the HCV database site is no longer funded. We try to keep the database updated and the tools running, but unfortunately, we cannot guarantee we can provide help for using this site. Data won't be manually curated either.
#k codon indel-tally syn-tally nonsyn-tally #k The number of codons is: 192 #k The average behavior for 10731 comparisons: #k Cumulative Per Codon #k __________________ __________________ #k codon indel syn nonsyn indel syn nonsyn aa avg syn 10 avg nonsyn 10 entropy Hb 1 0.01 0.49 0.33 0.01 0.49 0.33 V 0.325 0.343 0.558 -0.558 2 0.03 0.7 0.87 0.01 0.21 0.54 E 0.29 0.323 0.844 -0.844 3 0.04 0.98 0.9 0.01 0.29 0.04 V 0.276 0.27 0.081 -0.081 4 0.05 1.09 1.07 0.01 0.1 0.17 R 0.299 0.266 0.341 -0.341 5 0.07 1.16 1.07 0.01 0.08 0 N 0.336 0.249 0.041 -0.041 6 0.08 1.68 2.14 0.01 0.51 1.07 S 0.377 0.25 1.107 -1.107 7 0.1 2.2 2.51 0.01 0.53 0.36 S 0.333 0.143 0.536 -0.536 8 0.11 2.52 2.57 0.01 0.32 0.06 G 0.327 0.157 0.122 -0.122 9 0.12 3.14 3.43 0.01 0.62 0.86 V 0.309 0.151 1.469 -1.469 10 0.14 3.25 3.43 0.01 0.1 0 Y 0.297 0.086 0.041 -0.041 11 0.15 3.39 3.56 0.01 0.14 0.13 H 0.337 0.101 0.265 -0.265 12 0.16 3.45 3.57 0.01 0.07 0.01 V 0.34 0.093 0.081 -0.081 13 0.16 3.98 3.57 0 0.52 0 T 0.338 0.099 0 0 14 0.16 4.44 3.57 0 0.47 0 N 0.334 0.114 0 0 15 0.16 4.93 3.59 0 0.49 0.01 D 0.292 0.119 0.041 -0.041 16 0.16 5 3.59 0 0.07 0 C 0.294 0.167 0 0 17 0.16 5.47 4.08 0 0.47 0.5 P 0.334 0.214 0.718 -0.718 18 0.16 5.61 4.08 0 0.14 0 N 0.334 0.181 0 0 19 0.16 6.11 4.29 0 0.5 0.21 A 0.356 0.302 0.342 -0.342 20 0.16 6.61 4.44 0 0.5 0.15 S 0.332 0.284 0.113 -0.113 21 0.16 6.78 4.49 0 0.17 0.05 V 0.301 0.328 0.125 -0.125 22 0.16 6.83 4.56 0 0.05 0.07 V 0.331 0.326 0.113 -0.113 23 0.16 7.31 4.71 0 0.48 0.15 Y 0.379 0.378 0.308 -0.308 24 0.16 7.36 4.76 0 0.05 0.05 E 0.39 0.363 0.153 -0.153 25 0.16 7.87 5.25 0 0.51 0.49 T 0.4 0.358 0.762 -0.762 26 0.16 8.33 5.72 0 0.47 0.47 E 0.398 0.309 0.842 -0.842 27 0.16 8.81 5.89 0 0.47 0.17 S 0.406 0.271 0.361 -0.361 28 0.16 9.17 7.1 0 0.36 1.21 L 0.408 0.255 1.599 -1.599 29 0.16 9.43 7.13 0 0.26 0.03 I 0.382 0.137 0.072 -0.072 30 0.16 9.62 7.71 0 0.19 0.59 M 0.393 0.139 0.749 -0.749 31 0.16 10.09 7.74 0 0.47 0.03 H 0.423 0.104 0.081 -0.081 32 0.16 10.62 8.34 0 0.53 0.59 L 0.383 0.112 1.005 -1.005 33 0.16 11.21 8.34 0 0.59 0 P 0.379 0.151 0 0 34 0.16 11.36 8.34 0 0.15 0 G 0.347 0.16 0 0 35 0.16 11.85 8.34 0 0.49 0 C 0.346 0.256 0 0 36 0.16 12.4 8.43 0 0.55 0.09 V 0.352 0.263 0.234 -0.234 37 0.16 12.89 8.44 0 0.49 0.01 P 0.364 0.334 0.041 -0.041 38 0.16 12.99 8.47 0 0.1 0.03 C 0.364 0.333 0.081 -0.081 39 0.16 13.37 8.52 0 0.37 0.05 V 0.354 0.33 0.113 -0.113 40 0.16 13.86 8.76 0 0.49 0.24 R 0.37 0.332 0.403 -0.403 41 0.16 13.94 8.88 0 0.07 0.11 E 0.335 0.324 0.265 -0.265 42 0.16 14.42 9.86 0 0.49 0.98 G 0.379 0.379 1.263 -1.263 43 0.16 14.69 9.95 0 0.27 0.09 N 0.382 0.314 0.171 -0.171 44 0.16 14.83 10.91 0 0.14 0.96 A 0.37 0.306 1.541 -1.541 45 0.16 15.38 10.98 0 0.55 0.07 S 0.38 0.215 0.1 -0.1 46 0.16 16.05 11.79 0 0.67 0.8 R 0.387 0.263 0.495 -0.495 47 0.16 16.54 11.79 0 0.49 0 C 0.373 0.184 0 0 48 0.16 16.54 11.79 0 0 0 W 0.34 0.235 0 0 49 0.16 17.06 11.86 0 0.53 0.07 V 0.347 0.246 0.153 -0.153 50 0.16 17.2 12.01 0 0.14 0.16 S 0.334 0.295 0.35 -0.35 51 0.16 17.71 12.67 0 0.51 0.66 L 0.341 0.383 1.036 -1.036 52 0.16 18.23 13 0 0.52 0.33 S 0.301 0.419 0.565 -0.565 53 0.16 18.39 13.02 0 0.15 0.01 P 0.258 0.455 0.041 -0.041 54 0.16 18.63 13.07 0 0.24 0.05 T 0.256 0.463 0.113 -0.113 55 0.16 19.26 13.62 0 0.62 0.55 I 0.297 0.481 0.78 -0.78 56 0.16 19.79 13.64 0 0.53 0.01 A 0.242 0.459 0.041 -0.041 57 0.16 19.95 14.15 0 0.16 0.51 A 0.24 0.569 0.736 -0.736 58 0.16 20.01 14.25 0 0.07 0.11 K 0.274 0.576 0.229 -0.229 59 0.16 20.41 14.81 0 0.4 0.56 D 0.283 0.565 0.819 -0.819 60 0.16 20.63 15.86 0 0.21 1.04 P 0.304 0.526 1.608 -1.608 61 0.16 20.74 16.88 0 0.11 1.02 S 0.327 0.427 1.212 -1.212 62 0.16 20.83 17.57 0 0.09 0.69 V 0.321 0.374 1.134 -1.134 63 0.16 20.96 17.66 0 0.13 0.09 P 0.351 0.305 0.225 -0.225 64 0.16 21.61 17.89 0 0.65 0.23 V 0.387 0.303 0.394 -0.394 65 0.16 21.68 18.22 0 0.07 0.33 S 0.371 0.288 0.646 -0.646 66 0.16 22.19 19.33 0 0.51 1.11 E 0.416 0.258 1.082 -1.082 67 0.16 22.69 19.91 0 0.5 0.58 I 0.369 0.152 0.856 -0.856 68 0.16 22.85 19.91 0 0.16 0 R 0.368 0.205 0 0 69 0.16 23.46 20.07 0 0.61 0.17 R 0.402 0.205 0.277 -0.277 70 0.16 23.91 20.13 0 0.44 0.05 H 0.396 0.239 0.122 -0.122 71 0.16 23.96 20.62 0 0.05 0.49 V 0.36 0.284 0.683 -0.683 72 0.16 24.35 20.62 0 0.39 0 D 0.394 0.24 0 0 73 0.16 24.84 20.69 0 0.49 0.07 L 0.409 0.241 0.163 -0.163 74 0.16 25.34 20.77 0 0.49 0.08 I 0.411 0.239 0.165 -0.165 75 0.16 25.86 20.8 0 0.52 0.03 V 0.388 0.305 0.081 -0.081 76 0.16 25.9 20.86 0 0.04 0.05 G 0.369 0.302 0.122 -0.122 77 0.16 26.39 21.96 0 0.49 1.11 A 0.372 0.3 1.246 -1.246 78 0.16 26.89 21.96 0 0.5 0 A 0.344 0.192 0 0 79 0.16 27.44 22.47 0 0.55 0.51 A 0.344 0.192 0.726 -0.726 80 0.16 27.51 22.98 0 0.08 0.5 F 0.357 0.167 0.692 -0.692 81 0.16 27.91 23.02 0 0.39 0.05 C 0.361 0.117 0.113 -0.113 82 0.16 28.45 23.04 0 0.54 0.01 S 0.375 0.112 0.041 -0.041 83 0.16 28.96 23.09 0 0.51 0.05 A 0.345 0.117 0.14 -0.14 84 0.16 29.22 23.83 0 0.26 0.74 M 0.345 0.129 0.679 -0.679 85 0.16 29.55 23.83 0 0.33 0 Y 0.365 0.07 0 0 86 0.16 29.62 23.86 0 0.07 0.03 V 0.384 0.073 0.081 -0.081 87 0.16 29.83 23.89 0 0.21 0.03 G 0.399 0.087 0.081 -0.081 88 0.16 30.33 23.89 0 0.5 0 D 0.426 0.183 0 0 89 0.16 31.01 24.15 0 0.68 0.26 L 0.424 0.183 0.153 -0.153 90 0.16 31.12 24.15 0 0.12 0 C 0.374 0.168 0 0 91 0.16 31.66 24.15 0 0.53 0 G 0.383 0.172 0 0 92 0.16 31.9 24.21 0 0.24 0.06 S 0.356 0.181 0.113 -0.113 93 0.16 32.4 24.38 0 0.51 0.17 I 0.346 0.192 0.36 -0.36 94 0.16 32.86 24.54 0 0.46 0.15 F 0.366 0.178 0.283 -0.283 95 0.16 33.38 24.56 0 0.52 0.03 L 0.372 0.163 0.081 -0.081 96 0.16 33.6 24.73 0 0.22 0.17 V 0.373 0.211 0.337 -0.337 97 0.16 34.08 25.72 0 0.48 0.99 G 0.4 0.223 0.784 -0.784 98 0.16 34.56 25.72 0 0.48 0 Q 0.402 0.162 0 0 99 0.16 34.74 25.83 0 0.18 0.11 I 0.358 0.274 0.212 -0.212 100 0.16 34.95 25.87 0 0.21 0.04 F 0.389 0.277 0.122 -0.122 101 0.16 35.21 25.97 0 0.26 0.09 T 0.414 0.382 0.184 -0.184 102 0.16 35.35 26.13 0 0.14 0.17 F 0.437 0.377 0.395 -0.395 103 0.16 36.06 26.16 0 0.71 0.03 S 0.434 0.395 0.041 -0.041 104 0.16 36.57 26.16 0 0.52 0 P 0.378 0.392 0 0 105 0.16 37.11 26.67 0 0.53 0.51 R 0.368 0.393 0.113 -0.113 106 0.16 37.59 26.97 0 0.49 0.29 R 0.365 0.343 0.56 -0.56 107 0.16 38.09 27.35 0 0.5 0.38 H 0.379 0.315 0.602 -0.602 108 0.16 38.13 28.47 0 0.04 1.12 W 0.342 0.307 1.051 -1.051 109 0.16 38.62 28.6 0 0.49 0.14 T 0.373 0.195 0.225 -0.225 110 0.16 39.08 29.69 0 0.46 1.09 T 0.344 0.184 0.934 -0.934 111 0.16 39.56 29.73 0 0.49 0.04 Q 0.308 0.075 0.113 -0.113 112 0.16 39.68 30.08 0 0.11 0.35 D 0.308 0.079 0.668 -0.668 113 0.16 39.83 30.08 0 0.15 0 C 0.32 0.11 0 0 114 0.16 40.24 30.09 0 0.42 0.01 N 0.356 0.165 0.041 -0.041 115 0.16 40.74 30.11 0 0.5 0.01 C 0.343 0.165 0.041 -0.041 116 0.16 41.38 30.12 0 0.63 0.01 S 0.328 0.164 0.041 -0.041 117 0.16 41.51 30.43 0 0.13 0.3 I 0.298 0.163 0.588 -0.588 118 0.16 41.86 30.43 0 0.35 0 Y 0.285 0.133 0 0 119 0.16 42.06 30.45 0 0.2 0.03 P 0.311 0.133 0.041 -0.041 120 0.16 42.16 30.45 0 0.1 0 G 0.291 0.13 0 0 121 0.16 42.65 30.53 0 0.49 0.08 H 0.299 0.13 0.181 -0.181 122 0.16 42.89 31.19 0 0.23 0.66 V 0.25 0.123 0.967 -0.967 123 0.16 43.4 31.73 0 0.51 0.55 T 0.227 0.058 0.757 -0.757 124 0.16 43.69 31.75 0 0.29 0.01 G 0.176 0.004 0.041 -0.041 125 0.16 44.04 31.75 0 0.35 0 H 0.163 0.003 0 0 126 0.16 44.37 31.75 0 0.33 0 R 0.128 0.003 0.041 -0.041 127 0.16 44.37 31.75 0 0 0 M 0.162 0.003 0 0 128 0.16 44.98 31.75 0 0.61 0 A 0.193 0.003 0 0 129 0.16 44.98 31.75 0 0 0 W 0.178 0.007 0 0 130 0.16 45.16 31.75 0 0.18 0 D 0.226 0.062 0 0 131 0.16 45.16 31.76 0 0 0.01 M 0.268 0.066 0.041 -0.041 132 0.16 45.16 31.78 0 0 0.01 M 0.359 0.072 0.041 -0.041 133 0.16 45.16 31.79 0 0 0.01 M 0.407 0.084 0.041 -0.041 134 0.16 45.33 31.79 0 0.16 0 N 0.45 0.117 0 0 135 0.16 45.33 31.79 0 0 0 W 0.486 0.168 0 0 136 0.16 46 31.79 0 0.67 0 S 0.492 0.175 0 0 137 0.16 46.31 31.79 0 0.31 0 P 0.522 0.184 0 0 138 0.16 46.77 31.83 0 0.46 0.04 T 0.496 0.189 0.113 -0.113 139 0.16 47.25 32.38 0 0.48 0.55 G 0.48 0.185 0.797 -0.797 140 0.16 47.86 32.42 0 0.6 0.04 A 0.435 0.158 0.113 -0.113 141 0.16 48.76 32.49 0 0.91 0.07 L 0.417 0.155 0.153 -0.153 142 0.16 49.25 32.62 0 0.48 0.13 V 0.331 0.151 0.247 -0.247 143 0.16 49.68 32.96 0 0.43 0.34 M 0.329 0.15 0.591 -0.591 144 0.16 50.21 33.47 0 0.52 0.51 A 0.292 0.172 0.753 -0.753 145 0.16 50.27 33.54 0 0.06 0.07 Q 0.244 0.187 0.113 -0.113 146 0.16 51.24 33.63 0 0.97 0.09 L 0.272 0.18 0.181 -0.181 147 0.16 51.3 33.69 0 0.05 0.05 L 0.175 0.179 0.113 -0.113 148 0.16 51.6 33.69 0 0.3 0 R 0.202 0.248 0 0 149 0.16 51.63 33.97 0 0.03 0.28 I 0.229 0.267 0.489 -0.489 150 0.16 52.04 33.99 0 0.42 0.01 P 0.283 0.241 0.041 -0.041 151 0.16 52.1 34.01 0 0.05 0.03 Q 0.28 0.244 0.072 -0.072 152 0.16 52.56 34.13 0 0.46 0.12 A 0.28 0.241 0.27 -0.27 153 0.16 52.62 34.7 0 0.06 0.56 V 0.234 0.229 0.814 -0.814 154 0.16 52.65 35.36 0 0.04 0.66 V 0.249 0.173 1.113 -1.113 155 0.16 53 35.36 0 0.34 0 D 0.248 0.12 0 0 156 0.16 53 35.44 0 0 0.08 M 0.264 0.125 0.197 -0.197 157 0.16 53.31 36.18 0 0.32 0.74 I 0.267 0.129 0.755 -0.755 158 0.16 53.89 36.36 0 0.57 0.19 A 0.242 0.056 0.398 -0.398 159 0.16 54.45 36.38 0 0.57 0.02 G 0.246 0.093 0.041 -0.041 160 0.16 54.84 36.42 0 0.39 0.04 A 0.245 0.094 0.113 -0.113 161 0.18 54.89 36.42 0.01 0.05 0 H 0.25 0.09 0.041 -0.041 162 0.18 54.89 36.42 0 0 0 W 0.293 0.138 0 0 163 0.19 55.11 36.42 0.01 0.21 0 G 0.298 0.145 0.041 -0.041 164 0.19 55.13 36.55 0 0.03 0.13 V 0.278 0.149 0.271 -0.271 165 0.2 55.63 36.6 0.01 0.5 0.05 L 0.288 0.16 0.153 -0.153 166 0.2 55.66 36.72 0 0.03 0.12 A 0.251 0.158 0.181 -0.181 167 0.2 55.72 36.73 0 0.07 0.01 G 0.258 0.155 0.041 -0.041 168 0.2 56.33 37.29 0 0.61 0.56 L 0.251 0.154 0.844 -0.844 169 0.2 56.89 37.32 0 0.56 0.03 A 0.243 0.098 0.081 -0.081 170 0.22 57.33 37.32 0.01 0.44 0 Y 0.191 0.095 0.041 -0.041 171 0.23 57.81 37.8 0.01 0.48 0.48 Y 0.201 0.095 0.716 -0.716 172 0.24 57.86 37.87 0.01 0.05 0.07 S 0.209 0.066 0.206 -0.206 173 0.26 57.87 37.91 0.01 0.01 0.04 M 0.252 0.121 0.122 -0.122 174 0.27 58 38.15 0.01 0.13 0.24 V 0.259 0.122 0.464 -0.464 175 0.29 58.13 38.18 0.01 0.13 0.03 G 0.252 0.153 0.122 -0.122 176 0.3 58.23 38.28 0.01 0.1 0.09 N 0.321 0.151 0.184 -0.184 177 0.31 58.23 38.28 0.01 0 0 W 0.379 0.144 0.041 -0.041 178 0.33 58.76 38.28 0.01 0.53 0 A 0.406 0.149 0.041 -0.041 179 0.34 58.8 38.28 0.01 0.04 0 K 0.376 0.154 0.041 -0.041 180 0.37 59.34 38.28 0.03 0.54 0 V 0.382 0.161 0.072 -0.072 181 0.39 59.89 38.47 0.03 0.56 0.19 V 0.376 0.166 0.434 -0.434 182 0.42 60.38 39.08 0.03 0.48 0.62 V 0.351 0.147 0.859 -0.859 183 0.45 60.45 39.14 0.03 0.08 0.05 V 0.323 0.134 0.184 -0.184 184 0.48 60.52 39.68 0.03 0.06 0.55 L 0.35 0.143333333 0.815 -0.815 185 0.5 61.34 39.7 0.03 0.82 0.01 L 0.38625 0.0925 0.113 -0.113 186 0.53 62.02 39.72 0.03 0.68 0.02 L 0.324285714 0.104285714 0.072 -0.072 187 0.56 62.29 39.77 0.03 0.27 0.05 F 0.265 0.118333333 0.153 -0.153 188 0.58 62.52 39.83 0.03 0.23 0.05 A 0.264 0.132 0.212 -0.212 189 0.61 62.62 39.89 0.03 0.1 0.07 G 0.2725 0.1525 0.22 -0.22 190 0.64 63.11 39.94 0.03 0.48 0.05 V 0.33 0.18 0.184 -0.184 191 0.67 63.42 39.94 0.03 0.31 0 D 0.255 0.245 0.072 -0.072 192 0.69 63.62 40.43 0.03 0.2 0.49 A 0.2 0.49 0.788 -0.788