To our users Please note that the HCV database site is no longer funded. We try to keep the database updated and the tools running, but unfortunately, we cannot guarantee we can provide help for using this site. Data won't be manually curated either.
#k codon indel-tally syn-tally nonsyn-tally #k The number of codons is: 191 #k The average behavior for 231 comparisons: #k Cumulative Per Codon #k __________________ __________________ #k codon indel syn nonsyn indel syn nonsyn aa avg syn 10 avg nonsyn 10 entropy Hq 1 0 0 0 0 0 0 M 0.063 0.077 0 0 2 0 0 0 0 0 0 S 0.063 0.086 0 0 3 0 0 0 0 0 0 T 0.063 0.095 0 0 4 0 0 0.26 0 0 0.26 L 0.081 0.095 0.368 -0.368 5 0 0.37 0.26 0 0.37 0 P 0.098 0.069 0 0 6 0 0.37 0.35 0 0 0.09 K 0.106 0.069 0.185 -0.185 7 0 0.61 0.35 0 0.25 0 P 0.106 0.092 0 0 8 0 0.61 0.35 0 0 0 Q 0.129 0.092 0 0 9 0 0.61 0.45 0 0 0.09 R 0.138 0.092 0.185 -0.185 10 0 0.62 0.78 0 0.01 0.33 Q 0.163 0.083 0.576 -0.576 11 0 0.62 0.87 0 0 0.09 T 0.162 0.153 0.185 -0.185 12 0 0.62 0.96 0 0 0.09 K 0.179 0.144 0.185 -0.185 13 0 0.8 0.96 0 0.18 0 R 0.212 0.135 0 0 14 0 0.98 0.96 0 0.17 0 N 0.194 0.135 0 0 15 0 1.43 0.96 0 0.45 0 T 0.177 0.135 0 0 16 0 1.43 1.28 0 0 0.32 N 0.132 0.135 0.576 -0.576 17 0 1.91 1.28 0 0.48 0 R 0.184 0.103 0 0 18 0 2 1.28 0 0.09 0 R 0.175 0.103 0 0 19 0 2.25 1.28 0 0.25 0 P 0.22 0.103 0 0 20 0 2.25 2.31 0 0 1.03 Q 0.195 0.103 0.819 -0.819 21 0 2.42 2.31 0 0.17 0 D 0.195 0 0 0 22 0 2.75 2.31 0 0.33 0 V 0.223 0 0 0 23 0 2.75 2.31 0 0 0 K 0.227 0.009 0 0 24 0 2.75 2.31 0 0 0 F 0.227 0.009 0 0 25 0 2.75 2.31 0 0 0 P 0.291 0.009 0 0 26 0 3.27 2.31 0 0.52 0 G 0.291 0.009 0 0 27 0 3.66 2.31 0 0.39 0 G 0.256 0.009 0 0 28 0 4.2 2.31 0 0.54 0 G 0.278 0.009 0 0 29 0 4.2 2.31 0 0 0 Q 0.224 0.009 0 0 30 0 4.2 2.31 0 0 0 I 0.224 0.009 0 0 31 0 4.66 2.31 0 0.45 0 V 0.224 0.018 0 0 32 0 5.02 2.4 0 0.37 0.09 G 0.179 0.018 0.185 -0.185 33 0 5.02 2.4 0 0 0 G 0.219 0.009 0 0 34 0 5.66 2.4 0 0.64 0 V 0.311 0.023 0 0 35 0 5.66 2.4 0 0 0 Y 0.247 0.023 0 0 36 0 5.83 2.4 0 0.17 0 L 0.247 0.023 0 0 37 0 6.45 2.4 0 0.61 0 L 0.23 0.023 0 0 38 0 6.45 2.4 0 0 0 P 0.169 0.023 0 0 39 0 6.45 2.4 0 0 0 R 0.208 0.023 0 0 40 0 6.45 2.49 0 0 0.09 R 0.241 0.041 0.185 -0.185 41 0 6.45 2.49 0 0 0 G 0.293 0.032 0 0 42 0 7.22 2.49 0 0.77 0 P 0.302 0.032 0 0 43 0 8.15 2.63 0 0.92 0.14 R 0.269 0.032 0 0 44 0 8.15 2.63 0 0 0 L 0.239 0.018 0 0 45 0 8.15 2.63 0 0 0 G 0.284 0.018 0 0 46 0 8.15 2.63 0 0 0 V 0.335 0.018 0 0 47 0 8.15 2.63 0 0 0 R 0.335 0.018 0 0 48 0 8.53 2.63 0 0.39 0 A 0.344 0.018 0 0 49 0 8.86 2.81 0 0.33 0.18 V 0.33 0.027 0.185 -0.185 50 0 9.38 2.81 0 0.52 0 R 0.306 0.009 0 0 51 0 9.47 2.81 0 0.09 0 K 0.306 0.009 0 0 52 0 9.9 2.81 0 0.44 0 T 0.297 0.009 0 0 53 0 10.52 2.81 0 0.62 0 S 0.295 0.009 0 0 54 0 10.98 2.81 0 0.45 0 E 0.285 0.009 0 0 55 0 11.48 2.81 0 0.51 0 R 0.303 0.009 0 0 56 0 11.48 2.81 0 0 0 S 0.269 0.009 0 0 57 0 11.57 2.81 0 0.09 0 Q 0.308 0.009 0 0 58 0 11.82 2.91 0 0.25 0.09 P 0.33 0.009 0.185 -0.185 59 0 11.91 2.91 0 0.09 0 R 0.344 0.031 0 0 60 0 12.43 2.91 0 0.52 0 G 0.344 0.031 0 0 61 0 12.43 2.91 0 0 0 R 0.318 0.107 0 0 62 0 12.85 2.91 0 0.42 0 R 0.377 0.21 0 0 63 0 13.37 2.91 0 0.52 0 Q 0.356 0.316 0 0 64 0 13.99 2.91 0 0.63 0 P 0.313 0.316 0 0 65 0 14.17 2.91 0 0.17 0 I 0.319 0.335 0 0 66 0 14.55 2.91 0 0.39 0 P 0.302 0.466 0 0 67 0 14.87 2.91 0 0.31 0 K 0.263 0.466 0 0 68 0 15.26 3.22 0 0.39 0.31 A 0.265 0.503 0.474 -0.474 69 0 15.35 3.22 0 0.09 0 R 0.257 0.472 0 0 70 0 15.61 3.98 0 0.26 0.76 Q 0.3 0.472 1.169 -1.169 71 0 16.2 5.01 0 0.59 1.03 P 0.351 0.396 1.275 -1.275 72 0 16.41 6.07 0 0.21 1.06 T 0.317 0.293 0.819 -0.819 73 0 16.5 6.07 0 0.09 0 G 0.359 0.204 0 0 74 0 17.19 6.26 0 0.69 0.19 R 0.35 0.204 0 0 75 0 17.19 7.57 0 0 1.31 H 0.326 0.185 1.275 -1.275 76 0 17.19 7.57 0 0 0 W 0.382 0.054 0 0 77 0 17.52 7.94 0 0.33 0.37 A 0.407 0.054 0.536 -0.536 78 0 17.83 7.94 0 0.31 0 Q 0.445 0.017 0 0 79 0 18.35 7.94 0 0.52 0 P 0.466 0.026 0 0 80 0 19.12 7.94 0 0.77 0 G 0.423 0.026 0 0 81 0 19.37 7.94 0 0.25 0 Y 0.355 0.035 0 0 82 0 19.99 8.11 0 0.63 0.17 P 0.361 0.035 0.305 -0.305 83 0 19.99 8.11 0 0 0 W 0.368 0.018 0 0 84 0 20.45 8.11 0 0.45 0 P 0.368 0.018 0 0 85 0 21.01 8.11 0 0.56 0 L 0.362 0.038 0 0 86 0 21.25 8.11 0 0.25 0 Y 0.381 0.038 0 0 87 0 21.96 8.11 0 0.71 0 G 0.356 0.038 0 0 88 0 22.48 8.2 0 0.52 0.09 N 0.302 0.038 0.185 -0.185 89 0 22.57 8.2 0 0.09 0 E 0.281 0.049 0 0 90 0 22.66 8.29 0 0.09 0.09 G 0.297 0.049 0.185 -0.185 91 0 22.97 8.29 0 0.31 0 C 0.288 0.04 0 0 92 0 23.67 8.29 0 0.7 0 G 0.299 0.04 0 0 93 0 23.67 8.29 0 0 0 W 0.274 0.04 0 0 94 0 24.06 8.5 0 0.39 0.2 A 0.319 0.04 0.185 -0.185 95 0 24.81 8.5 0 0.75 0 G 0.345 0.02 0 0 96 0 24.81 8.5 0 0 0 W 0.339 0.02 0 0 97 0 24.98 8.5 0 0.17 0 L 0.384 0.124 0 0 98 0 25.29 8.7 0 0.31 0.2 L 0.367 0.124 0.368 -0.368 99 0 25.54 8.7 0 0.25 0 S 0.345 0.104 0 0 100 0 25.54 8.7 0 0 0 P 0.376 0.104 0 0 101 0 25.95 8.7 0 0.42 0 R 0.418 0.113 0 0 102 0 26.41 8.7 0 0.45 0 G 0.376 0.113 0 0 103 0 26.86 8.7 0 0.45 0 S 0.331 0.113 0 0 104 0 27.52 8.7 0 0.65 0 R 0.286 0.113 0 0 105 0 28.21 8.7 0 0.69 0 P 0.282 0.113 0 0 106 0 28.66 9.74 0 0.45 1.04 N 0.304 0.113 1.286 -1.286 107 0 28.66 9.74 0 0 0 W 0.311 0.009 0 0 108 0 28.75 9.74 0 0.09 0 G 0.362 0.009 0 0 109 0 29.3 9.74 0 0.56 0 P 0.404 0.009 0 0 110 0 29.72 9.83 0 0.42 0.09 N 0.382 0.009 0.185 -0.185 111 0 29.72 9.83 0 0 0 D 0.34 0 0 0 112 0 29.72 9.83 0 0 0 P 0.385 0.009 0 0 113 0 29.72 9.83 0 0 0 R 0.385 0.009 0 0 114 0 30.33 9.83 0 0.61 0 R 0.385 0.009 0.185 -0.185 115 0 31.24 9.83 0 0.91 0 R 0.355 0.009 0 0 116 0 31.76 9.83 0 0.52 0 S 0.264 0.009 0 0 117 0 32.27 9.83 0 0.51 0 R 0.287 0.032 0 0 118 0 32.77 9.83 0 0.51 0 N 0.31 0.032 0 0 119 0 33.11 9.83 0 0.34 0 L 0.298 0.032 0 0 120 0 33.11 9.83 0 0 0 G 0.306 0.042 0 0 121 0 33.56 9.92 0 0.45 0.09 K 0.347 0.099 0.185 -0.185 122 0 33.56 9.92 0 0 0 V 0.302 0.09 0 0 123 0 33.56 9.92 0 0 0 I 0.339 0.09 0 0 124 0 33.88 9.92 0 0.31 0 D 0.339 0.09 0 0 125 0 33.88 9.92 0 0 0 T 0.308 0.09 0 0 126 0 34.63 10.15 0 0.75 0.23 L 0.308 0.108 0.305 -0.305 127 0 35.37 10.15 0 0.74 0 T 0.242 0.085 0 0 128 0 35.76 10.15 0 0.39 0 C 0.216 0.085 0.185 -0.185 129 0 36.18 10.25 0 0.42 0.1 D 0.236 0.085 0.185 -0.185 130 0 36.59 10.82 0 0.41 0.57 L 0.211 0.075 0.819 -0.819 131 0 36.59 10.82 0 0 0 A 0.23 0.083 0 0 132 0 36.95 10.82 0 0.37 0 D 0.295 0.083 0 0 133 0 36.95 10.82 0 0 0 L 0.324 0.128 0 0 134 0 36.95 10.82 0 0 0 M 0.401 0.128 0 0 135 0 36.95 11 0 0 0.18 G 0.482 0.171 0.368 -0.368 136 0 37.05 11 0 0.09 0 Y 0.557 0.153 0 0 137 0 37.53 11 0 0.48 0 I 0.58 0.153 0 0 138 0 38.12 11 0 0.59 0 P 0.563 0.153 0 0 139 0 38.29 11 0 0.17 0 V 0.536 0.153 0 0 140 0 38.89 11.65 0 0.6 0.65 L 0.574 0.153 0.967 -0.967 141 0 39.54 11.65 0 0.65 0 G 0.577 0.1 0 0 142 0 40.21 12.11 0 0.66 0.45 A 0.596 0.119 0.625 -0.625 143 0 40.98 12.11 0 0.77 0 P 0.586 0.074 0 0 144 0 41.79 12.54 0 0.81 0.43 L 0.526 0.074 0 0 145 0 42.54 12.54 0 0.75 0 G 0.506 0.031 0 0 146 0 42.87 12.54 0 0.32 0 G 0.499 0.031 0 0 147 0 43.18 12.54 0 0.31 0 V 0.484 0.031 0 0 148 0 43.5 12.54 0 0.32 0 A 0.508 0.056 0 0 149 0 44.06 12.54 0 0.55 0 A 0.513 0.11 0 0 150 0 44.69 12.66 0 0.63 0.12 A 0.495 0.11 0.185 -0.185 151 0 45.54 12.85 0 0.84 0.19 L 0.441 0.098 0.185 -0.185 152 0 46.09 12.85 0 0.56 0 A 0.357 0.079 0 0 153 0 46.27 12.85 0 0.17 0 H 0.366 0.127 0 0 154 0 46.87 12.85 0 0.61 0 G 0.394 0.127 0 0 155 0 47.55 12.85 0 0.68 0 V 0.37 0.127 0 0 156 0 47.73 12.85 0 0.17 0 R 0.302 0.127 0 0 157 0 48.28 13.1 0 0.55 0.25 A 0.302 0.127 0.398 -0.398 158 0 48.64 13.64 0 0.37 0.54 I 0.265 0.102 0.843 -0.843 159 0 49.01 13.64 0 0.37 0 E 0.245 0.048 0 0 160 0 49.1 13.64 0 0.09 0 D 0.247 0.081 0 0 161 0 49.1 13.64 0 0 0 G 0.286 0.09 0 0 162 0 49.75 14.12 0 0.65 0.48 I 0.286 0.09 0.655 -0.655 163 0 50.21 14.12 0 0.45 0 N 0.221 0.042 0 0 164 0 50.58 14.12 0 0.37 0 Y 0.228 0.042 0 0 165 0 50.58 14.12 0 0 0 A 0.243 0.042 0 0 166 0 50.75 14.12 0 0.17 0 T 0.243 0.051 0 0 167 0 50.93 14.12 0 0.18 0 G 0.235 0.051 0 0 168 0 51.1 14.12 0 0.17 0 N 0.226 0.051 0 0 169 0 51.5 14.46 0 0.39 0.33 L 0.261 0.076 0.185 -0.185 170 0 51.98 14.55 0 0.48 0.09 P 0.264 0.043 0.185 -0.185 171 0 51.98 14.55 0 0 0 G 0.216 0.034 0 0 172 0 51.98 14.55 0 0 0 C 0.288 0.038 0 0 173 0 52.5 14.55 0 0.52 0 S 0.339 0.076 0 0 174 0 53.02 14.55 0 0.52 0 F 0.305 0.076 0 0 175 0 53.02 14.64 0 0 0.09 S 0.253 0.076 0.185 -0.185 176 0 53.11 14.64 0 0.09 0 I 0.298 0.067 0 0 177 0 53.2 14.64 0 0.09 0 F 0.363 0.067 0.185 -0.185 178 0 53.72 14.89 0 0.52 0.25 L 0.424 0.103 0.398 -0.398 179 0 54.14 14.89 0 0.42 0 L 0.433 0.078 0 0 180 0 54.14 14.89 0 0 0 A 0.417 0.087 0 0 181 0 54.86 14.93 0 0.72 0.04 L 0.483 0.087 0 0 182 0 55.37 15.31 0 0.51 0.38 L 0.482 0.083 0.305 -0.305 183 0 55.55 15.31 0 0.18 0 S 0.478888889 0.05 0 0 184 0 55.55 15.31 0 0 0 C 0.51625 0.05625 0 0 185 0 56 15.31 0 0.45 0 L 0.59 0.064285714 0 0 186 0 56.74 15.31 0 0.74 0 T 0.613333333 0.075 0 0 187 0 57.43 15.67 0 0.7 0.36 T 0.588 0.09 0.305 -0.305 188 0 58.04 15.67 0 0.61 0 P 0.56 0.0225 0 0 189 0 58.3 15.76 0 0.26 0.09 A 0.543333333 0.03 0.185 -0.185 190 0 58.96 15.76 0 0.66 0 S 0.685 0 0 0 191 0 59.67 15.76 0 0.71 0 A 0.71 0 0 0