To our users Please note that the HCV database site is no longer funded. We try to keep the database updated and the tools running, but unfortunately, we cannot guarantee we can provide help for using this site. Data won't be manually curated either.
#k codon indel-tally syn-tally nonsyn-tally #k The number of codons is: 191 #k The average behavior for 66 comparisons: #k Cumulative Per Codon #k __________________ __________________ #k codon indel syn nonsyn indel syn nonsyn aa avg syn 10 avg nonsyn 10 entropy Hq 1 0 0 0 0 0 0 M 0.017 0.017 0 0 2 0 0 0 0 0 0 S 0.017 0.017 0 0 3 0 0.17 0 0 0.17 0 T 0.017 0.017 0 0 4 0 0.17 0 0 0 0 N 0 0.017 0 0 5 0 0.17 0 0 0 0 P 0 0.017 0 0 6 0 0.17 0 0 0 0 K 0 0.017 0 0 7 0 0.17 0.17 0 0 0.17 P 0 0.017 0.287 -0.287 8 0 0.17 0.17 0 0 0 Q 0.03 0 0 0 9 0 0.17 0.17 0 0 0 R 0.03 0 0 0 10 0 0.17 0.17 0 0 0 K 0.092 0 0 0 11 0 0.17 0.17 0 0 0 T 0.092 0.017 0 0 12 0 0.17 0.17 0 0 0 K 0.109 0.017 0 0 13 0 0.17 0.17 0 0 0 R 0.141 0.017 0 0 14 0 0.17 0.17 0 0 0 N 0.158 0.017 0 0 15 0 0.17 0.17 0 0 0 T 0.158 0.017 0 0 16 0 0.17 0.17 0 0 0 N 0.175 0.017 0 0 17 0 0.47 0.17 0 0.3 0 R 0.223 0.017 0 0 18 0 0.47 0.17 0 0 0 R 0.234 0.017 0 0 19 0 1.09 0.17 0 0.62 0 P 0.275 0.034 0 0 20 0 1.09 0.33 0 0 0.17 M 0.213 0.034 0.287 -0.287 21 0 1.26 0.33 0 0.17 0 D 0.213 0.017 0 0 22 0 1.58 0.33 0 0.32 0 V 0.196 0.017 0 0 23 0 1.74 0.33 0 0.17 0 K 0.164 0.017 0 0 24 0 1.74 0.33 0 0 0 F 0.147 0.017 0 0 25 0 1.91 0.33 0 0.17 0 P 0.147 0.017 0 0 26 0 2.39 0.33 0 0.48 0 G 0.13 0.017 0 0 27 0 2.8 0.33 0 0.41 0 G 0.082 0.017 0 0 28 0 3.21 0.5 0 0.41 0.17 G 0.058 0.017 0.287 -0.287 29 0 3.21 0.5 0 0 0 Q 0.017 0 0 0 30 0 3.21 0.5 0 0 0 I 0.034 0 0 0 31 0 3.21 0.5 0 0 0 V 0.034 0 0 0 32 0 3.21 0.5 0 0 0 G 0.034 0 0 0 33 0 3.21 0.5 0 0 0 G 0.087 0 0 0 34 0 3.21 0.5 0 0 0 V 0.181 0 0 0 35 0 3.21 0.5 0 0 0 Y 0.181 0 0 0 36 0 3.21 0.5 0 0 0 L 0.181 0 0 0 37 0 3.38 0.5 0 0.17 0 L 0.181 0 0 0 38 0 3.38 0.5 0 0 0 P 0.164 0 0 0 39 0 3.55 0.5 0 0.17 0 R 0.181 0 0 0 40 0 3.55 0.5 0 0 0 R 0.164 0.017 0 0 41 0 3.55 0.5 0 0 0 G 0.229 0.017 0 0 42 0 4.08 0.5 0 0.53 0 P 0.229 0.017 0 0 43 0 5.02 0.5 0 0.94 0 R 0.176 0.017 0 0 44 0 5.02 0.5 0 0 0 L 0.082 0.017 0 0 45 0 5.02 0.5 0 0 0 G 0.082 0.017 0 0 46 0 5.02 0.5 0 0 0 V 0.082 0.017 0 0 47 0 5.02 0.5 0 0 0 R 0.099 0.017 0 0 48 0 5.18 0.5 0 0.17 0 A 0.099 0.017 0 0 49 0 5.18 0.67 0 0 0.17 T 0.082 0.017 0.287 -0.287 50 0 5.83 0.67 0 0.65 0 R 0.082 0 0 0 51 0 5.83 0.67 0 0 0 K 0.061 0 0 0 52 0 5.83 0.67 0 0 0 T 0.109 0 0 0 53 0 5.83 0.67 0 0 0 S 0.139 0 0 0 54 0 5.83 0.67 0 0 0 E 0.18 0 0 0 55 0 5.83 0.67 0 0 0 R 0.18 0 0 0 56 0 6 0.67 0 0.17 0 S 0.18 0 0 0 57 0 6 0.67 0 0 0 Q 0.163 0 0 0 58 0 6 0.67 0 0 0 P 0.163 0 0 0 59 0 6 0.67 0 0 0 R 0.18 0 0 0 60 0 6.44 0.67 0 0.44 0 G 0.222 0 0 0 61 0 6.92 0.67 0 0.48 0 R 0.208 0.041 0 0 62 0 7.23 0.67 0 0.3 0 R 0.177 0.129 0 0 63 0 7.64 0.67 0 0.41 0 Q 0.147 0.129 0 0 64 0 7.64 0.67 0 0 0 P 0.165 0.129 0 0 65 0 7.64 0.67 0 0 0 I 0.206 0.129 0 0 66 0 7.64 0.67 0 0 0 P 0.206 0.129 0 0 67 0 7.64 0.67 0 0 0 K 0.206 0.129 0 0 68 0 7.8 0.67 0 0.17 0 A 0.277 0.129 0 0 69 0 8.23 0.67 0 0.42 0 R 0.301 0.129 0 0 70 0 8.53 1.08 0 0.3 0.41 Q 0.327 0.129 0.562 -0.562 71 0 8.7 1.95 0 0.17 0.88 T 0.338 0.088 1.265 -1.265 72 0 8.7 1.95 0 0 0 E 0.362 0 0 0 73 0 9.29 1.95 0 0.59 0 G 0.41 0 0 0 74 0 9.7 1.95 0 0.41 0 R 0.351 0 0 0 75 0 9.7 1.95 0 0 0 S 0.355 0 0 0 76 0 9.7 1.95 0 0 0 W 0.355 0.017 0 0 77 0 10.41 1.95 0 0.71 0 A 0.372 0.034 0 0 78 0 10.82 1.95 0 0.41 0 Q 0.337 0.034 0 0 79 0 11.5 1.95 0 0.68 0 P 0.296 0.034 0 0 80 0 11.91 1.95 0 0.41 0 G 0.228 0.034 0 0 81 0 12.32 1.95 0 0.41 0 Y 0.228 0.034 0 0 82 0 12.8 1.95 0 0.48 0 P 0.235 0.034 0 0 83 0 12.8 1.95 0 0 0 W 0.187 0.034 0 0 84 0 13.26 1.95 0 0.45 0 P 0.187 0.034 0.287 -0.287 85 0 13.26 2.12 0 0 0.17 F 0.19 0.034 0.287 -0.287 86 0 13.42 2.29 0 0.17 0.17 F 0.245 0.017 0.287 -0.287 87 0 13.79 2.29 0 0.36 0 G 0.228 0 0.287 -0.287 88 0 13.79 2.29 0 0 0 N 0.192 0 0 0 89 0 13.79 2.29 0 0 0 E 0.24 0 0 0 90 0 14.2 2.29 0 0.41 0 G 0.288 0 0 0 91 0 14.68 2.29 0 0.48 0 C 0.295 0 0 0 92 0 14.68 2.29 0 0 0 G 0.3 0 0 0 93 0 14.68 2.29 0 0 0 W 0.339 0 0 0 94 0 15.17 2.29 0 0.48 0 A 0.356 0 0 0 95 0 15.71 2.29 0 0.55 0 G 0.373 0 0 0 96 0 15.71 2.29 0 0 0 W 0.318 0 0 0 97 0 15.71 2.29 0 0 0 L 0.335 0 0 0 98 0 16.2 2.29 0 0.48 0 L 0.335 0 0 0 99 0 16.68 2.29 0 0.48 0 S 0.304 0 0 0 100 0 17.17 2.29 0 0.48 0 P 0.332 0 0 0 101 0 17.7 2.29 0 0.53 0 R 0.301 0 0 0 102 0 18.09 2.29 0 0.39 0 G 0.248 0 0 0 103 0 18.26 2.29 0 0.17 0 S 0.209 0 0 0 104 0 18.91 2.29 0 0.65 0 R 0.209 0 0 0 105 0 18.91 2.29 0 0 0 P 0.173 0.015 0.451 -0.451 106 0 19.08 2.29 0 0.17 0 S 0.203 0.015 0 0 107 0 19.08 2.29 0 0 0 W 0.186 0.015 0 0 108 0 19.24 2.29 0 0.17 0 G 0.203 0.015 0 0 109 0 20 2.29 0 0.76 0 P 0.234 0.015 0 0 110 0 20.17 2.29 0 0.17 0 N 0.199 0.015 0 0 111 0 20.17 2.29 0 0 0 D 0.182 0.015 0 0 112 0 20.17 2.29 0 0 0 P 0.212 0.032 0 0 113 0 20.33 2.29 0 0.17 0 R 0.212 0.049 0 0 114 0 20.62 2.44 0 0.29 0.15 R 0.195 0.049 0.566 -0.566 115 0 20.92 2.44 0 0.3 0 R 0.166 0.051 0 0 116 0 20.92 2.44 0 0 0 S 0.136 0.068 0 0 117 0 21.09 2.44 0 0.17 0 R 0.168 0.068 0 0 118 0 21.58 2.44 0 0.48 0 N 0.228 0.068 0 0 119 0 21.98 2.44 0 0.41 0 L 0.204 0.068 0 0 120 0 21.98 2.44 0 0 0 G 0.163 0.068 0 0 121 0 22.29 2.61 0 0.3 0.17 K 0.18 0.068 0.287 -0.287 122 0 22.29 2.77 0 0 0.17 V 0.15 0.051 0.287 -0.287 123 0 22.29 2.77 0 0 0 I 0.15 0.034 0 0 124 0 22.29 2.94 0 0 0.17 D 0.15 0.034 0.287 -0.287 125 0 22.29 3.11 0 0 0.17 T 0.15 0.017 0.287 -0.287 126 0 22.61 3.11 0 0.32 0 L 0.15 0 0 0 127 0 23.38 3.11 0 0.77 0 T 0.118 0.017 0 0 128 0 23.62 3.11 0 0.24 0 C 0.064 0.042 0.451 -0.451 129 0 23.62 3.11 0 0 0 G 0.057 0.042 0 0 130 0 23.79 3.11 0 0.17 0 F 0.098 0.09 0 0 131 0 23.79 3.11 0 0 0 A 0.098 0.09 0 0 132 0 23.79 3.11 0 0 0 D 0.128 0.107 0 0 133 0 23.79 3.11 0 0 0 L 0.128 0.107 0 0 134 0 23.79 3.11 0 0 0 M 0.172 0.107 0 0 135 0 23.79 3.11 0 0 0 G 0.217 0.107 0 0 136 0 23.79 3.27 0 0 0.17 Y 0.217 0.107 0.287 -0.287 137 0 24.02 3.52 0 0.23 0.25 I 0.217 0.107 0.287 -0.287 138 0 24.19 3.52 0 0.17 0 P 0.194 0.082 0 0 139 0 24.6 4.01 0 0.41 0.48 L 0.177 0.082 0.637 -0.637 140 0 24.77 4.01 0 0.17 0 V 0.191 0.034 0 0 141 0 25.07 4.17 0 0.3 0.17 G 0.191 0.034 0.287 -0.287 142 0 25.07 4.17 0 0 0 A 0.191 0.017 0 0 143 0 25.51 4.17 0 0.44 0 P 0.25 0.034 0 0 144 0 25.96 4.17 0 0.45 0 V 0.259 0.034 0 0 145 0 25.96 4.17 0 0 0 G 0.256 0.034 0 0 146 0 25.96 4.34 0 0 0.17 G 0.304 0.051 0.287 -0.287 147 0 25.96 4.34 0 0 0 V 0.304 0.034 0 0 148 0 25.96 4.34 0 0 0 A 0.345 0.123 0 0 149 0 26.51 4.34 0 0.55 0 R 0.35 0.171 0 0 150 0 26.67 4.34 0 0.17 0 A 0.35 0.171 0 0 151 0 26.98 4.34 0 0.3 0 L 0.333 0.171 0 0 152 0 27.57 4.51 0 0.59 0.17 A 0.32 0.171 0.287 -0.287 153 0 28.1 4.51 0 0.53 0 H 0.291 0.195 0 0 154 0 28.52 4.51 0 0.42 0 G 0.279 0.195 0 0 155 0 29.01 4.67 0 0.48 0.17 V 0.267 0.195 0.287 -0.287 156 0 29.01 4.67 0 0 0 R 0.236 0.178 0 0 157 0 29.42 5.57 0 0.41 0.89 V 0.236 0.178 0.824 -0.824 158 0 29.46 6.05 0 0.05 0.48 V 0.195 0.089 0.637 -0.637 159 0 30.01 6.05 0 0.55 0 E 0.22 0.041 0 0 160 0 30.01 6.05 0 0 0 D 0.206 0.058 0 0 161 0 30.17 6.05 0 0.17 0 G 0.259 0.058 0 0 162 0 30.48 6.46 0 0.3 0.41 I 0.242 0.058 0.562 -0.562 163 0 30.89 6.46 0 0.41 0 N 0.212 0.017 0 0 164 0 31.19 6.46 0 0.3 0 Y 0.219 0.017 0 0 165 0 31.36 6.46 0 0.17 0 A 0.234 0.017 0 0 166 0 31.36 6.46 0 0 0 T 0.217 0.017 0 0 167 0 31.36 6.46 0 0 0 G 0.217 0.017 0 0 168 0 31.66 6.46 0 0.3 0 N 0.234 0.017 0 0 169 0 32.07 6.63 0 0.41 0.17 I 0.245 0.034 0.287 -0.287 170 0 32.6 6.63 0 0.53 0 P 0.236 0.032 0 0 171 0 32.6 6.63 0 0 0 G 0.2 0.032 0 0 172 0 32.6 6.63 0 0 0 C 0.229 0.032 0 0 173 0 33.08 6.63 0 0.48 0 S 0.27 0.032 0 0 174 0 33.54 6.63 0 0.45 0 F 0.222 0.032 0.287 -0.287 175 0 33.54 6.63 0 0 0 S 0.177 0.032 0 0 176 0 33.54 6.63 0 0 0 I 0.207 0.032 0 0 177 0 33.7 6.63 0 0.17 0 F 0.224 0.032 0 0 178 0 34.11 6.8 0 0.41 0.17 L 0.266 0.065 0.287 -0.287 179 0 34.43 6.95 0 0.32 0.15 L 0.254 0.048 0 0 180 0 34.6 6.95 0 0.17 0 A 0.284 0.069 0 0 181 0 34.89 6.95 0 0.29 0 L 0.282 0.069 0 0 182 0 35.3 6.95 0 0.41 0 L 0.268 0.084 0 0 183 0 35.3 6.95 0 0 0 S 0.252222222 0.093333333 0 0 184 0 35.3 6.95 0 0 0 C 0.28375 0.105 0 0 185 0 35.6 6.95 0 0.3 0 L 0.324285714 0.12 0 0 186 0 35.77 6.95 0 0.17 0 T 0.328333333 0.14 0 0 187 0 36.36 7.28 0 0.59 0.33 V 0.36 0.168 0.287 -0.287 188 0.17 36.64 7.28 0.17 0.29 0 P 0.3025 0.1275 0 0 189 0.33 37.27 7.64 0.17 0.62 0.36 A 0.306666667 0.17 0.824 -0.824 190 0.5 37.42 7.64 0.17 0.15 0 S 0.15 0.075 0.287 -0.287 191 0.67 37.57 7.8 0.17 0.15 0.15 A 0.15 0.15 0.566 -0.566