To our users Please note that the HCV database site is no longer funded. We try to keep the database updated and the tools running, but unfortunately, we cannot guarantee we can provide help for using this site. Data won't be manually curated either.
#k codon indel-tally syn-tally nonsyn-tally #k The number of codons is: 191 #k The average behavior for 153 comparisons: #k Cumulative Per Codon #k __________________ __________________ #k codon indel syn nonsyn indel syn nonsyn aa avg syn 10 avg nonsyn 10 entropy Hb 1 0 0 0 0 0 0 M 0.056 0.092 0 0 2 0 0 0 0 0 0 S 0.067 0.092 0 0 3 0 0.06 0.17 0 0.06 0.17 T 0.067 0.092 0.215 -0.215 4 0 0.06 0.39 0 0 0.22 L 0.061 0.075 0.215 -0.215 5 0 0.17 0.39 0 0.11 0 P 0.061 0.053 0 0 6 0 0.17 0.39 0 0 0 K 0.071 0.064 0 0 7 0 0.56 0.39 0 0.39 0 P 0.071 0.116 0 0 8 0 0.56 0.5 0 0 0.11 Q 0.074 0.116 0.215 -0.215 9 0 0.56 0.5 0 0 0 R 0.113 0.105 0 0 10 0 0.56 0.92 0 0 0.42 I 0.113 0.105 0.684 -0.684 11 0 0.67 0.92 0 0.11 0 T 0.113 0.074 0 0 12 0 0.67 0.92 0 0 0 K 0.102 0.103 0 0 13 0 0.67 0.92 0 0 0 R 0.159 0.124 0 0 14 0 0.67 0.92 0 0 0 N 0.159 0.124 0 0 15 0 0.88 1.03 0 0.21 0.11 T 0.159 0.124 0.215 -0.215 16 0 0.88 1.55 0 0 0.52 N 0.159 0.113 0.761 -0.761 17 0 1.3 1.55 0 0.42 0 R 0.188 0.072 0 0 18 0 1.7 1.55 0 0.39 0 R 0.157 0.072 0 0 19 0 1.7 1.55 0 0 0 P 0.179 0.072 0 0 20 0 1.7 1.66 0 0 0.11 Q 0.179 0.094 0.215 -0.215 21 0 1.7 1.95 0 0 0.29 D 0.179 0.083 0.451 -0.451 22 0 2.26 2.16 0 0.57 0.21 V 0.179 0.076 0.349 -0.349 23 0 2.26 2.16 0 0 0 K 0.133 0.066 0 0 24 0 2.26 2.16 0 0 0 F 0.144 0.077 0 0 25 0 2.47 2.16 0 0.21 0 P 0.173 0.077 0 0 26 0 2.77 2.27 0 0.29 0.11 G 0.173 0.077 0.215 -0.215 27 0 2.88 2.27 0 0.11 0 G 0.166 0.066 0 0 28 0 3.49 2.27 0 0.61 0 G 0.218 0.066 0 0 29 0 3.49 2.49 0 0 0.22 Q 0.188 0.066 0.215 -0.215 30 0 3.49 2.49 0 0 0 I 0.199 0.044 0 0 31 0 3.49 2.72 0 0 0.22 V 0.199 0.044 0.215 -0.215 32 0 3.6 2.83 0 0.11 0.11 G 0.21 0.022 0.215 -0.215 33 0 3.71 2.94 0 0.11 0.11 G 0.23 0.011 0.215 -0.215 34 0 4 2.94 0 0.29 0 V 0.274 0.06 0 0 35 0 4.21 2.94 0 0.21 0 Y 0.245 0.06 0 0 36 0 4.43 2.94 0 0.22 0 V 0.224 0.06 0 0 37 0 5.06 2.94 0 0.63 0 L 0.202 0.06 0 0 38 0 5.37 2.94 0 0.31 0 P 0.168 0.081 0 0 39 0 5.48 2.94 0 0.11 0 R 0.174 0.092 0 0 40 0 5.48 2.94 0 0 0 R 0.191 0.174 0 0 41 0 5.59 2.94 0 0.11 0 G 0.212 0.174 0 0 42 0 5.9 2.94 0 0.31 0 P 0.243 0.174 0 0 43 0 6.45 3.54 0 0.55 0.6 K 0.212 0.174 0.761 -0.761 44 0 6.45 3.54 0 0 0 L 0.199 0.114 0 0 45 0 6.45 3.54 0 0 0 G 0.241 0.114 0 0 46 0 6.45 3.54 0 0 0 V 0.261 0.126 0 0 47 0 6.74 3.75 0 0.29 0.21 R 0.303 0.126 0.349 -0.349 48 0 7.11 3.86 0 0.37 0.11 A 0.316 0.105 0.215 -0.215 49 0 7.39 4.68 0 0.28 0.82 V 0.308 0.094 0.73 -0.73 50 0 7.6 4.68 0 0.21 0 R 0.302 0.012 0 0 51 0 8.02 4.68 0 0.42 0 K 0.3 0.052 0 0 52 0 8.02 4.68 0 0 0 T 0.34 0.052 0 0 53 0 8.45 4.68 0 0.42 0 S 0.393 0.052 0 0 54 0 8.87 4.68 0 0.42 0 E 0.38 0.063 0 0 55 0 9.07 4.8 0 0.2 0.12 R 0.359 0.063 0.215 -0.215 56 0 9.5 4.8 0 0.42 0 S 0.35 0.062 0 0 57 0 9.92 4.8 0 0.42 0 Q 0.308 0.062 0 0 58 0 10.22 4.8 0 0.29 0 P 0.266 0.083 0 0 59 0 10.43 4.8 0 0.22 0 R 0.258 0.083 0 0 60 0 10.62 5.2 0 0.19 0.4 S 0.278 0.094 0.557 -0.557 61 0 11.44 5.2 0 0.82 0 R 0.296 0.085 0 0 62 0 11.97 5.2 0 0.53 0 R 0.214 0.137 0 0 63 0 12.27 5.31 0 0.29 0.11 Q 0.201 0.169 0.215 -0.215 64 0 12.47 5.31 0 0.21 0 P 0.193 0.158 0 0 65 0 12.59 5.42 0 0.11 0.11 I 0.194 0.158 0.215 -0.215 66 0 12.59 5.42 0 0 0 P 0.183 0.158 0 0 67 0 12.59 5.63 0 0 0.21 R 0.183 0.158 0.349 -0.349 68 0 12.79 5.63 0 0.21 0 A 0.222 0.137 0 0 69 0 13.22 5.74 0 0.42 0.11 R 0.201 0.137 0.215 -0.215 70 0 13.59 6.05 0 0.37 0.31 R 0.196 0.126 0.557 -0.557 71 0 13.59 6.56 0 0 0.52 T 0.159 0.095 0.884 -0.884 72 0 13.98 6.88 0 0.4 0.32 E 0.159 0.043 0.634 -0.634 73 0 14.19 6.88 0 0.21 0 G 0.13 0.011 0 0 74 0 14.41 6.88 0 0.22 0 R 0.109 0.011 0 0 75 0 14.41 7 0 0 0.11 S 0.087 0.011 0.215 -0.215 76 0 14.41 7 0 0 0 W 0.118 0 0 0 77 0 14.79 7 0 0.39 0 A 0.139 0 0 0 78 0 14.79 7 0 0 0 Q 0.137 0 0 0 79 0 15.16 7 0 0.37 0 P 0.184 0 0 0 80 0 15.16 7 0 0 0 G 0.147 0 0 0 81 0 15.16 7 0 0 0 Y 0.147 0 0 0 82 0 15.27 7 0 0.11 0 P 0.168 0 0 0 83 0 15.27 7 0 0 0 W 0.178 0 0 0 84 0 15.27 7 0 0 0 P 0.178 0 0 0 85 0 15.58 7 0 0.31 0 L 0.178 0 0 0 86 0 15.79 7 0 0.21 0 Y 0.189 0 0 0 87 0 16.15 7 0 0.37 0 G 0.168 0 0 0 88 0 16.62 7 0 0.47 0 N 0.131 0.011 0 0 89 0 16.62 7 0 0 0 E 0.095 0.011 0 0 90 0 16.62 7 0 0 0 G 0.095 0.022 0 0 91 0 16.83 7 0 0.21 0 C 0.16 0.022 0 0 92 0 17.04 7 0 0.21 0 G 0.139 0.022 0 0 93 0 17.04 7 0 0 0 W 0.139 0.022 0 0 94 0 17.04 7 0 0 0 A 0.186 0.022 0 0 95 0 17.47 7 0 0.42 0 G 0.232 0.022 0 0 96 0 17.47 7 0 0 0 W 0.211 0.022 0 0 97 0 17.47 7.11 0 0 0.11 L 0.261 0.109 0.215 -0.215 98 0 17.58 7.11 0 0.11 0 L 0.261 0.098 0 0 99 0 17.58 7.22 0 0 0.11 S 0.25 0.109 0.215 -0.215 100 0 18.23 7.22 0 0.65 0 P 0.26 0.12 0 0 101 0 18.23 7.22 0 0 0 R 0.237 0.12 0 0 102 0 18.44 7.22 0 0.21 0 G 0.237 0.12 0 0 103 0 18.91 7.22 0 0.47 0 S 0.216 0.12 0 0 104 0 19.37 7.22 0 0.46 0 R 0.169 0.12 0 0 105 0 19.58 7.22 0 0.21 0 P 0.191 0.12 0 0 106 0 20.08 8.09 0 0.5 0.87 S 0.249 0.12 0.634 -0.634 107 0 20.08 8.09 0 0 0 W 0.21 0.033 0 0 108 0 20.08 8.2 0 0 0.11 G 0.21 0.033 0.215 -0.215 109 0 20.18 8.41 0 0.1 0.22 P 0.247 0.022 0.349 -0.349 110 0 20.61 8.41 0 0.42 0 N 0.237 0 0 0 111 0 20.61 8.41 0 0 0 D 0.206 0 0 0 112 0 20.61 8.41 0 0 0 P 0.256 0 0 0 113 0 20.61 8.41 0 0 0 R 0.256 0.011 0 0 114 0 21.29 8.41 0 0.68 0 R 0.256 0.011 0 0 115 0 22.08 8.41 0 0.79 0 R 0.199 0.011 0 0 116 0 22.19 8.41 0 0.11 0 S 0.12 0.011 0 0 117 0 22.19 8.41 0 0 0 R 0.171 0.011 0 0 118 0 22.55 8.41 0 0.37 0 N 0.182 0.011 0 0 119 0 22.55 8.41 0 0 0 L 0.156 0.011 0 0 120 0 22.66 8.41 0 0.11 0 G 0.178 0.011 0 0 121 0 23.17 8.41 0 0.5 0 K 0.178 0.011 0 0 122 0 23.17 8.53 0 0 0.11 V 0.139 0.011 0.215 -0.215 123 0 23.17 8.53 0 0 0 I 0.16 0 0 0 124 0 23.28 8.53 0 0.11 0 D 0.16 0 0 0 125 0 23.28 8.53 0 0 0 T 0.149 0 0 0 126 0 23.9 8.53 0 0.62 0 L 0.149 0 0 0 127 0 24.01 8.53 0 0.11 0 T 0.108 0 0 0 128 0 24.12 8.53 0 0.11 0 C 0.134 0 0 0 129 0 24.34 8.53 0 0.22 0 G 0.134 0 0 0 130 0 24.45 8.53 0 0.11 0 F 0.112 0 0 0 131 0 24.56 8.53 0 0.11 0 A 0.131 0.011 0 0 132 0 24.77 8.53 0 0.21 0 D 0.12 0.011 0 0 133 0 24.77 8.53 0 0 0 L 0.146 0.011 0 0 134 0 24.77 8.53 0 0 0 M 0.193 0.011 0 0 135 0 24.77 8.53 0 0 0 G 0.241 0.022 0 0 136 0 24.98 8.53 0 0.21 0 Y 0.288 0.022 0 0 137 0 25.34 8.53 0 0.37 0 I 0.267 0.022 0 0 138 0 25.46 8.53 0 0.11 0 P 0.241 0.033 0 0 139 0 25.46 8.53 0 0 0 L 0.241 0.033 0 0 140 0 25.76 8.64 0 0.3 0.11 V 0.27 0.033 0.215 -0.215 141 0 25.76 8.64 0 0 0 G 0.261 0.022 0 0 142 0 26.23 8.64 0 0.47 0 A 0.292 0.033 0 0 143 0 26.7 8.64 0 0.47 0 P 0.298 0.033 0 0 144 0 27.18 8.75 0 0.48 0.11 V 0.262 0.033 0.215 -0.215 145 0 27.65 8.75 0 0.47 0 G 0.253 0.022 0 0 146 0 27.65 8.75 0 0 0 G 0.241 0.038 0 0 147 0 27.76 8.86 0 0.11 0.11 V 0.299 0.038 0.215 -0.215 148 0 27.87 8.86 0 0.11 0 A 0.334 0.027 0 0 149 0 28.16 8.86 0 0.29 0 R 0.334 0.038 0 0 150 0 28.37 8.86 0 0.21 0 A 0.355 0.038 0 0 151 0 28.68 8.97 0 0.31 0.11 L 0.334 0.038 0.215 -0.215 152 0 29.21 8.97 0 0.53 0 A 0.34 0.027 0 0 153 0 29.32 8.97 0 0.11 0 H 0.324 0.058 0 0 154 0 29.71 8.97 0 0.39 0 G 0.334 0.058 0 0 155 0 30.06 9.13 0 0.35 0.16 I 0.332 0.087 0.215 -0.215 156 0 30.63 9.13 0 0.58 0 R 0.308 0.071 0 0 157 0 31.1 9.13 0 0.46 0 A 0.25 0.071 0 0 158 0 31.21 9.24 0 0.11 0.11 L 0.204 0.071 0.215 -0.215 159 0 31.71 9.24 0 0.5 0 E 0.235 0.06 0 0 160 0 31.71 9.24 0 0 0 D 0.238 0.089 0 0 161 0 32.08 9.24 0 0.37 0 G 0.275 0.089 0 0 162 0 32.45 9.55 0 0.37 0.31 I 0.238 0.089 0.349 -0.349 163 0 32.66 9.55 0 0.21 0 N 0.201 0.058 0 0 164 0 33.03 9.85 0 0.37 0.29 F 0.217 0.058 0.451 -0.451 165 0 33.14 9.85 0 0.11 0 A 0.217 0.029 0 0 166 0 33.14 9.85 0 0 0 T 0.206 0.029 0 0 167 0 33.14 9.85 0 0 0 G 0.206 0.029 0 0 168 0 33.56 9.85 0 0.42 0 N 0.217 0.029 0 0 169 0 34.09 10.14 0 0.53 0.29 L 0.212 0.029 0 0 170 0 34.46 10.14 0 0.37 0 P 0.222 0.018 0 0 171 0 34.46 10.14 0 0 0 G 0.206 0.018 0 0 172 0 34.46 10.14 0 0 0 C 0.258 0.036 0 0 173 0 34.82 10.14 0 0.37 0 S 0.269 0.073 0 0 174 0 35.19 10.14 0 0.37 0 F 0.285 0.073 0 0 175 0 35.19 10.14 0 0 0 S 0.248 0.073 0 0 176 0 35.19 10.14 0 0 0 I 0.311 0.073 0 0 177 0 35.3 10.14 0 0.11 0 F 0.363 0.123 0 0 178 0 35.67 10.14 0 0.37 0 L 0.386 0.221 0 0 179 0 36.29 10.33 0 0.63 0.18 L 0.391 0.221 0 0 180 0 36.5 10.33 0 0.21 0 A 0.355 0.213 0 0 181 0 37.02 10.51 0 0.52 0.18 L 0.381 0.24 0.215 -0.215 182 0 37.13 10.88 0 0.11 0.37 L 0.354 0.273 0.53 -0.53 183 0 37.66 10.88 0 0.53 0 S 0.381111111 0.262222222 0 0 184 0 37.66 10.88 0 0 0 C 0.3625 0.295 0 0 185 0 38.29 10.88 0 0.63 0 L 0.414285714 0.337142857 0 0 186 0 38.82 11.38 0 0.52 0.5 L 0.378333333 0.393333333 0.778 -0.778 187 0.11 39.16 12.36 0.11 0.34 0.98 T 0.35 0.372 1.08 -1.08 188 0.22 39.58 12.36 0.11 0.42 0 P 0.3525 0.22 0.215 -0.215 189 0.33 39.85 12.46 0.11 0.27 0.1 A 0.33 0.293333333 0.426 -0.426 190 0.44 40.32 12.74 0.11 0.47 0.27 A 0.36 0.39 0.655 -0.655 191 0.56 40.57 13.25 0.11 0.25 0.51 G 0.25 0.51 0.73 -0.73