To our users Please note that the HCV database site is no longer funded. We try to keep the database updated and the tools running, but unfortunately, we cannot guarantee we can provide help for using this site. Data won't be manually curated either.
#k codon indel-tally syn-tally nonsyn-tally #k The number of codons is: 191 #k The average behavior for 595 comparisons: #k Cumulative Per Codon #k __________________ __________________ #k codon indel syn nonsyn indel syn nonsyn aa avg syn 10 avg nonsyn 10 entropy Hq 1 0 0 0 0 0 0 M 0.017 0.017 0 0 2 0 0 0 0 0 0 S 0.023 0.017 0 0 3 0 0.06 0 0 0.06 0 T 0.023 0.017 0 0 4 0 0.06 0.06 0 0 0.06 N 0.017 0.017 0.13 -0.13 5 0 0.17 0.06 0 0.11 0 P 0.028 0.017 0 0 6 0 0.17 0.06 0 0 0 K 0.081 0.017 0 0 7 0 0.17 0.06 0 0 0 P 0.081 0.017 0 0 8 0 0.17 0.06 0 0 0 Q 0.131 0.017 0 0 9 0 0.17 0.06 0 0 0 R 0.131 0.017 0 0 10 0 0.17 0.17 0 0 0.11 I 0.131 0.017 0.219 -0.219 11 0 0.23 0.17 0 0.06 0 T 0.175 0.012 0 0 12 0 0.23 0.17 0 0 0 K 0.169 0.018 0 0 13 0 0.23 0.17 0 0 0 R 0.213 0.018 0 0 14 0 0.34 0.23 0 0.11 0.06 N 0.213 0.018 0.13 -0.13 15 0 0.97 0.23 0 0.64 0 T 0.246 0.012 0 0 16 0 0.97 0.23 0 0 0 N 0.182 0.012 0 0 17 0 1.48 0.23 0 0.5 0 R 0.226 0.012 0 0 18 0 1.48 0.23 0 0 0 R 0.218 0.012 0 0 19 0 1.48 0.23 0 0 0 P 0.243 0.012 0 0 20 0 1.92 0.28 0 0.44 0.06 Q 0.249 0.012 0.13 -0.13 21 0 1.92 0.34 0 0 0.06 D 0.205 0.006 0.13 -0.13 22 0 2.36 0.34 0 0.44 0 V 0.205 0 0 0 23 0 2.36 0.34 0 0 0 K 0.167 0 0 0 24 0 2.81 0.34 0 0.44 0 F 0.167 0 0 0 25 0 2.81 0.34 0 0 0 P 0.167 0 0 0 26 0 3.25 0.34 0 0.44 0 G 0.167 0 0 0 27 0 3.67 0.34 0 0.42 0 G 0.123 0 0 0 28 0 3.92 0.34 0 0.25 0 G 0.138 0 0 0 29 0 3.98 0.34 0 0.06 0 Q 0.113 0 0 0 30 0 3.98 0.34 0 0 0 I 0.107 0 0 0 31 0 3.98 0.34 0 0 0 V 0.107 0 0 0 32 0 4.04 0.34 0 0.06 0 G 0.107 0 0 0 33 0 4.04 0.34 0 0 0 G 0.136 0 0 0 34 0 4.48 0.34 0 0.44 0 V 0.181 0 0 0 35 0 4.48 0.34 0 0 0 Y 0.137 0 0 0 36 0 4.48 0.34 0 0 0 L 0.137 0 0 0 37 0 5.05 0.34 0 0.57 0 L 0.137 0 0 0 38 0 5.05 0.34 0 0 0 P 0.08 0 0 0 39 0 5.05 0.34 0 0 0 R 0.091 0.016 0 0 40 0 5.05 0.34 0 0 0 R 0.135 0.048 0 0 41 0 5.05 0.34 0 0 0 G 0.135 0.048 0 0 42 0 5.4 0.34 0 0.35 0 P 0.168 0.048 0 0 43 0 5.85 0.34 0 0.45 0 R 0.139 0.059 0 0 44 0 5.85 0.34 0 0 0 L 0.15 0.059 0 0 45 0 5.85 0.34 0 0 0 G 0.196 0.059 0 0 46 0 5.85 0.34 0 0 0 V 0.24 0.059 0 0 47 0 5.85 0.34 0 0 0 R 0.24 0.059 0 0 48 0 5.96 0.5 0 0.11 0.16 A 0.24 0.059 0.293 -0.293 49 0 6.4 0.82 0 0.44 0.32 T 0.281 0.043 0.546 -0.546 50 0 6.4 0.82 0 0 0 R 0.243 0.011 0 0 51 0 6.73 0.82 0 0.33 0 K 0.287 0.022 0 0 52 0 6.79 0.94 0 0.06 0.11 T 0.304 0.022 0.259 -0.259 53 0 7.35 0.94 0 0.56 0 S 0.298 0.011 0 0 54 0 7.82 0.94 0 0.46 0 E 0.242 0.011 0 0 55 0 8.26 0.94 0 0.44 0 R 0.196 0.017 0 0 56 0 8.26 0.94 0 0 0 S 0.152 0.017 0 0 57 0 8.26 0.94 0 0 0 Q 0.222 0.023 0 0 58 0 8.78 0.94 0 0.52 0 P 0.228 0.029 0 0 59 0 8.84 0.94 0 0.06 0 R 0.176 0.04 0 0 60 0 9.28 1.05 0 0.44 0.11 E 0.17 0.04 0.259 -0.259 61 0 9.78 1.05 0 0.5 0 R 0.132 0.029 0 0 62 0 9.78 1.05 0 0 0 R 0.088 0.083 0 0 63 0 9.78 1.05 0 0 0 Q 0.134 0.089 0 0 64 0 9.78 1.11 0 0 0.06 P 0.134 0.089 0.13 -0.13 65 0 9.78 1.11 0 0 0 I 0.145 0.089 0 0 66 0 10.48 1.16 0 0.7 0.06 P 0.145 0.1 0.13 -0.13 67 0 10.54 1.22 0 0.06 0.06 K 0.075 0.094 0.13 -0.13 68 0 10.54 1.33 0 0 0.11 D 0.08 0.088 0.219 -0.219 69 0 10.54 1.33 0 0 0 R 0.133 0.166 0 0 70 0 10.6 1.33 0 0.06 0 R 0.144 0.166 0 0 71 0 10.65 1.87 0 0.06 0.54 S 0.144 0.166 0.897 -0.897 72 0 11.12 1.93 0 0.46 0.06 T 0.187 0.123 0.13 -0.13 73 0 11.12 1.93 0 0 0 G 0.187 0.117 0 0 74 0 11.23 1.98 0 0.11 0.06 K 0.187 0.117 0.13 -0.13 75 0 11.23 2.1 0 0 0.11 S 0.197 0.111 0.259 -0.259 76 0 11.23 2.1 0 0 0 W 0.241 0.1 0 0 77 0 11.34 2.1 0 0.11 0 G 0.285 0.1 0 0 78 0 11.87 2.99 0 0.53 0.89 R 0.318 0.106 0.741 -0.741 79 0 11.98 2.99 0 0.11 0 P 0.315 0.017 0 0 80 0 12.03 2.99 0 0.06 0 G 0.304 0.017 0 0 81 0 12.53 3.1 0 0.49 0.11 Y 0.363 0.017 0.13 -0.13 82 0 12.99 3.1 0 0.46 0 P 0.325 0.09 0 0 83 0 12.99 3.1 0 0 0 W 0.318 0.09 0 0 84 0 13.2 3.1 0 0.21 0 P 0.318 0.09 0 0 85 0 13.64 3.1 0 0.44 0 L 0.308 0.09 0 0 86 0 14.08 3.1 0 0.44 0 Y 0.329 0.09 0 0 87 0 14.52 3.16 0 0.44 0.06 G 0.285 0.09 0.13 -0.13 88 0 15.03 3.16 0 0.5 0 N 0.247 0.084 0 0 89 0 15.03 3.16 0 0 0 E 0.197 0.084 0 0 90 0 15.67 3.16 0 0.65 0 G 0.203 0.084 0 0 91 0 15.78 4 0 0.11 0.84 L 0.149 0.084 0.598 -0.598 92 0 16.17 4 0 0.39 0 G 0.192 0 0 0 93 0 16.17 4 0 0 0 W 0.22 0 0 0 94 0 16.29 4 0 0.11 0 A 0.264 0 0 0 95 0 16.93 4 0 0.65 0 G 0.302 0.011 0 0 96 0 16.93 4 0 0 0 W 0.289 0.011 0 0 97 0 16.99 4 0 0.06 0 L 0.346 0.076 0 0 98 0 16.99 4 0 0 0 L 0.34 0.076 0 0 99 0 17.05 4 0 0.06 0 S 0.34 0.076 0 0 100 0 17.16 4 0 0.11 0 P 0.355 0.076 0 0 101 0 17.7 4 0 0.54 0 R 0.387 0.124 0 0 102 0 18.37 4 0 0.67 0 G 0.339 0.124 0 0 103 0 18.81 4 0 0.44 0 S 0.272 0.124 0 0 104 0 19.31 4.11 0 0.49 0.11 R 0.228 0.124 0.219 -0.219 105 0 19.82 4.11 0 0.52 0 P 0.215 0.113 0 0 106 0 20.39 4.77 0 0.57 0.65 S 0.214 0.142 0.861 -0.861 107 0 20.39 4.77 0 0 0 W 0.214 0.077 0 0 108 0 20.39 4.77 0 0 0 G 0.243 0.077 0 0 109 0 20.6 4.77 0 0.21 0 P 0.294 0.077 0 0 110 0 21.02 5.25 0 0.43 0.48 T 0.28 0.123 0.772 -0.772 111 0 21.08 5.25 0 0.06 0 D 0.281 0.075 0 0 112 0 21.08 5.25 0 0 0 P 0.319 0.096 0 0 113 0 21.08 5.25 0 0 0 R 0.319 0.096 0 0 114 0 21.44 5.25 0 0.36 0 H 0.319 0.096 0 0 115 0 21.96 5.54 0 0.51 0.29 R 0.322 0.096 0.458 -0.458 116 0 22.52 5.54 0 0.57 0 S 0.271 0.067 0 0 117 0 22.82 5.54 0 0.29 0 R 0.279 0.107 0 0 118 0 23.33 5.54 0 0.51 0 N 0.276 0.107 0 0 119 0 23.4 6 0 0.07 0.46 L 0.276 0.107 0.643 -0.643 120 0 23.84 6 0 0.44 0 G 0.32 0.072 0 0 121 0 24.29 6.21 0 0.44 0.21 K 0.276 0.083 0.355 -0.355 122 0 24.29 6.21 0 0 0 V 0.232 0.068 0 0 123 0 24.29 6.21 0 0 0 I 0.243 0.068 0 0 124 0 24.68 6.21 0 0.39 0 D 0.243 0.068 0 0 125 0 24.68 6.21 0 0 0 T 0.204 0.074 0 0 126 0 25.33 6.61 0 0.65 0.4 L 0.21 0.074 0.57 -0.57 127 0 25.59 6.61 0 0.26 0 T 0.151 0.034 0 0 128 0 26.1 6.61 0 0.51 0 C 0.174 0.045 0 0 129 0 26.61 6.73 0 0.51 0.11 G 0.174 0.045 0.219 -0.219 130 0 26.61 6.84 0 0 0.11 F 0.123 0.034 0.219 -0.219 131 0 26.61 6.89 0 0 0.06 A 0.196 0.029 0.13 -0.13 132 0 26.72 6.89 0 0.11 0 D 0.196 0.023 0 0 133 0 26.72 6.89 0 0 0 L 0.214 0.029 0 0 134 0 26.72 6.95 0 0 0.06 M 0.267 0.029 0.13 -0.13 135 0 26.78 6.95 0 0.06 0 G 0.313 0.073 0 0 136 0 26.84 6.95 0 0.06 0 Y 0.368 0.086 0 0 137 0 27.33 7.06 0 0.49 0.11 I 0.373 0.086 0.219 -0.219 138 0 27.84 7.06 0 0.51 0 P 0.368 0.081 0 0 139 0 27.84 7.06 0 0 0 V 0.317 0.081 0 0 140 0 28.57 7.12 0 0.73 0.06 V 0.317 0.092 0.13 -0.13 141 0 28.57 7.12 0 0 0 G 0.27 0.086 0 0 142 0 28.86 7.18 0 0.29 0.06 A 0.316 0.092 0.13 -0.13 143 0 29.4 7.18 0 0.53 0 P 0.353 0.086 0 0 144 0 29.85 7.68 0 0.46 0.5 V 0.351 0.086 0.643 -0.643 145 0 30.46 7.81 0 0.61 0.13 G 0.369 0.036 0.219 -0.219 146 0 30.57 7.81 0 0.11 0 G 0.354 0.023 0 0 147 0 31.02 7.87 0 0.44 0.06 V 0.4 0.023 0.13 -0.13 148 0 31.02 7.87 0 0 0 A 0.394 0.023 0 0 149 0 31.02 7.98 0 0 0.11 R 0.394 0.023 0.259 -0.259 150 0 31.27 7.98 0 0.26 0 A 0.436 0.012 0 0 151 0 31.74 8.04 0 0.46 0.06 L 0.416 0.012 0.13 -0.13 152 0 32.39 8.04 0 0.66 0 A 0.386 0.006 0 0 153 0 32.9 8.04 0 0.51 0 H 0.366 0.054 0 0 154 0 33.54 8.04 0 0.64 0 G 0.357 0.054 0 0 155 0 34 8.04 0 0.46 0 V 0.326 0.083 0 0 156 0 34.57 8.04 0 0.57 0 R 0.28 0.083 0 0 157 0 34.95 8.09 0 0.38 0.06 V 0.248 0.083 0.13 -0.13 158 0 34.95 8.09 0 0 0 L 0.216 0.083 0 0 159 0 35.37 8.09 0 0.42 0 E 0.267 0.083 0 0 160 0 35.43 8.09 0 0.06 0 D 0.309 0.083 0 0 161 0 35.59 8.09 0 0.16 0 G 0.353 0.083 0 0 162 0 36.05 8.58 0 0.46 0.48 I 0.337 0.083 0.66 -0.66 163 0 36.47 8.58 0 0.42 0 N 0.291 0.041 0 0 164 0 36.8 8.87 0 0.33 0.29 Y 0.299 0.047 0.458 -0.458 165 0 36.8 8.87 0 0 0 A 0.287 0.018 0 0 166 0 37.06 8.87 0 0.25 0 T 0.287 0.018 0 0 167 0 37.11 8.93 0 0.06 0.06 G 0.283 0.018 0.13 -0.13 168 0 37.62 8.93 0 0.51 0 N 0.302 0.012 0 0 169 0 38.46 8.93 0 0.84 0 L 0.327 0.038 0 0 170 0 38.96 8.93 0 0.5 0 P 0.331 0.059 0 0 171 0 38.96 8.93 0 0 0 G 0.333 0.065 0 0 172 0 38.96 8.98 0 0 0.06 C 0.412 0.068 0.13 -0.13 173 0 39.47 9.04 0 0.5 0.06 S 0.469 0.066 0.13 -0.13 174 0 39.68 9.04 0 0.21 0 F 0.491 0.06 0 0 175 0 39.68 9.04 0 0 0 S 0.495 0.06 0 0 176 0 39.88 9.04 0 0.21 0 I 0.506 0.128 0 0 177 0 40.14 9.04 0 0.25 0 F 0.555 0.161 0 0 178 0 40.9 9.3 0 0.76 0.26 L 0.574 0.229 0 0 179 0 41.78 9.51 0 0.88 0.21 L 0.551 0.203 0.13 -0.13 180 0 42.29 9.57 0 0.52 0.06 A 0.528 0.205 0.13 -0.13 181 0 43.08 9.6 0 0.79 0.03 L 0.529 0.199 0 0 182 0 43.65 9.64 0 0.57 0.04 L 0.52 0.213 0 0 183 0 44.38 9.64 0 0.72 0 S 0.514444444 0.232222222 0 0 184 0 44.63 9.64 0 0.25 0 C 0.48875 0.26125 0 0 185 0 44.74 10.31 0 0.11 0.68 I 0.522857143 0.298571429 1.067 -1.067 186 0 45.44 10.64 0 0.7 0.33 T 0.591666667 0.235 0.5 -0.5 187 0 45.88 11.32 0 0.44 0.68 A 0.57 0.216 0.811 -0.811 188 0 46.41 11.32 0 0.53 0 P 0.6025 0.1 0 0 189 0 47.06 11.55 0 0.65 0.23 V 0.626666667 0.133333333 0.219 -0.219 190 0 47.59 11.55 0 0.53 0 S 0.615 0.085 0 0 191 0 48.29 11.72 0 0.7 0.17 A 0.7 0.17 0.347 -0.347